蛋白质二级结构预测相关论文
神经网络作为机器学习的重要方法,在生物信息学领域中取得了广泛的应用,尤其是生物序列的模式分析中,如蛋白质的分类、启动子的识......
Spike神经元是人工神经元发展的第三代模型,由于它具有生物神经元的动态发放特性,能处理时间模式的问题,所以对Spike神经元的研究......
随着人类基因组计划的完成,人们获得了大量的生物学数据。在对这些生物数据进行处理和分析的过程中,涌现出了大量的数学问题。这些数......
蛋白质结构预测(Protein Structure Prediction,PSP)是生物信息学研究的重点和难点。随着基因组测序的完成,大量冗余的蛋白质序列......
蛋白质是一切生命的物质基础,没有蛋白质就没有生命,更谈不上人类的繁衍生息,氨基酸是蛋白质的基本组成元素,蛋白质是由不同种类的......
【摘要】 本文提出一种蛋白质二级结构预测的方法。该方法首先对数据集中的氨基酸序列采用疏水性编码,然后采用支持向量机算法,利用......
随着人类基因组计划和模式生物基因组计划的完成,公共数据库中生物数据的增长速度越来越快.如何从海量的生物数据中解读、提取和获......
蛋白质是一种高分子化合物,它作为生命活动的重要承担者,主要表现在其生物功能上,这些功能又由蛋白质的空间结构决定,因此搞清蛋白质结......
蛋白质二级结构预测是生物信息学研究的重要组成部分.蛋白质二级结构的预测既有助于了解蛋白质的功能及其作用机制,对于正确预测蛋......
提出了一种新的蛋白质二级结构预测方法. 该方法从氨基酸序列中提取出和自然语言中的“词”类似的与物种相关的蛋白质二级结构词条......
在蛋白质二级结构预测中,常用的氨基酸序列编码方法产生的编码除了具有较高的维数外,也没有利用氨基酸序列片段中的统计信息。为此,提......
实验对当今主流的3种蛋白质数据训练集进行了研究.目的是为了建立一个新的训练集从而能更准确的把蛋白质的每个氨基酸残基归类为正......
蛋白质结构预测是后基因组时代的一项重要任务,蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的关键步骤。现在一般认为,如果蛋白质二级结构......
蛋白质二级结构预测是后基因组学的重要内容,是准确预测蛋白质分子三维空间结构的关键步骤。为此,提出基于混合并行遗传算法(HPGA)的......
蛋白质二级结构预测问题,是生物信息学领域中最为重要的任务之一,历经三十多年的研究,已取得了一些进展,尤其是近来集成预测模型与......
生物信息学是在生命科学研究中独具活力的新兴前沿学科之一。它利用计算机硬件、软件和计算机网络,采用信息学、计算机科学和数学的......
针对3-状态隐马尔可夫模型(hidden Markov model,HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出15-状态HMM,通过改进的算法与BP神......
蛋白质二级结构预测是后基因组学的重要内容,是能准确预测蛋白质分子三维空间结构的关键步骤,它被证明是个NP难问题。同时,蛋白质数据......
为研究蛋白质二级结构预测时采用哪种氨基酸编码方式具有更好的预测精度,使用正交编码、5位编码、Codon编码(2种)和Profile编码等5种......
蛋白质二级结构预测方法的研究目前已成为生物信息学研究的重要课题之一。为此,从从头预测、比较建模和混合方法3个方面阐述了近几......
大豆蛋白质是人类生活不可或缺的物质,对大豆蛋白质二级结构预测是能够准确预测蛋白质分子三维空间结构功能的关键步骤。将聚类分析......
编码方式是影响蛋白质二级结构预测准确率的重要因素之一。针对单序列蛋白质二级结构预测问题,提出了一种新的综合编码方法。该编......
神经网络具有容易陷入局部极小的缺点,动态隧道神经网络通过"钻隧道"方式,让目标函数跳出局部最小,找到更小的可行域,从而避免神经网......
提出一种基于小波核支持向量机分类模型,将其用于SARS蛋白质二级结构预测.实验表明,该模型与其他同类方法相比,提高蛋白质二级结构......
基于SQL Server数据库管理系统,将蛋白质二级结构预测的样本集CB513、CB396和RS126组织起来,建立了数据库DataSet,并配置了一个IIS服......
针对3-状态隐马尔可夫模型(HMM)预测蛋白质二级结构准确率不高的问题,提出了7-状态和15-状态HMM。研究对象为CB513数据集合中筛选出的......
主要介绍构造性机器学习方法即改进牛顿算法在蛋白质二级结构预测中的应用。针对标准BP算法存在的缺点,讨论用迭代矩阵替换二级微商......
在传统的Chou-Fasman蛋白质二级结构预测方法的基础上引入同义密码子使用的信息,计算了200个蛋白(49种全α结构蛋白,69种全β结构蛋......
蛋白质二级结构预测是公认的生物信息学领域的国际性难题。以基于内在认知机理的知识发现理论(knowledge discovery theory based o......
应用计算智能方法分析,有效地处理现实世界中的大规模数据,是当今人工智能、机器学习等领域所追求的目标之一.简单综述了SVM用于处......
提出一种新的氨基酸编码方式,即基团编码,基团编码是对20种氨基酸进行的编码方式,含有42个属性,然后采用这种新的编码方式进行蛋白......
蛋白质结构预测在生物信息学研究中占有重要地位。对神经网络在蛋白质结构预测中的应用作了评述。首先,简要地介绍了人工神经网络,然......
近几年随着人们对复杂巨系统认识的深入,对它不同层次上相对独立个体的属性和结构的研究,以及在分析工作中遇到的困难,越来越多地......
将ELM应用到蛋白质二级结构模型的训练中,在此基础上提出了基于概率的合并算法(probability-based combining,PBC),用该算法预测结果......
随着后基因时代的到来,蛋白质组学研究正成为生命科学中一个重要的研究领域。在目前的蛋白质组学研究中,蛋白质二级结构预测仍然是......
对蛋白质二级结构进行预测,有助于理解蛋白质的三级结构,进而理解蛋白质的生物功能和蛋白质分子之间的相互作用关系。围绕蛋白质二......
蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测和理解蛋白质结构和功能的重要课题,主要工作是依据蛋白质氨基酸序列的编码特征正确识别出对......
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蛋白质的一级结构或序列与二级结构的关系在蛋白质结构研究中是很重要的.通过建立模型的方法来研究这种关系.在文献中已有的模型(蛋白......
提出一种蛋白质二级结构预测的新方法。该方法首先对数据集中的氨基酸序列利用PSI—BLAST程序进行同源序列搜索,得到相应的PSSM矩阵......
蛋白质二级结构预测是蛋白质结构研究的一个重要环节,大量的新预测方法被提出的同时,也不断有新的蛋白质二级结构预测服务器出现。......
介绍了蛋白质二级结构预测的研究意义,讨论了用在蛋白质二级结构预测方面的神经网络设计问题,并且较详尽地评述了近些年来用神经网络......
蛋白质二级结构预测是进行蛋白质三级结构研究的重要基础,氨基酸的编码方式对二级结构预测有一定的影响。本文应用了一种新的组合......
ue*M#’#dkB4##8#”专利申请号:00109“7公开号:1278062申请日:00.06.23公开日:00.12.27申请人地址:(100084川C京市海淀区清华园申请人:清......
随着生物测序技术的快速发展,生物科学的数据资源无论从数量上还是从质量上都得到了极大的丰富与提升。数据资源的急剧膨胀使得我......
本文介绍了基于图像分类的技术进行蛋白质二级结构预测的方法.该方法从蛋白质氨基酸在空间的距离矩阵入手,将距离矩阵作为图像进行......
蛋白质结构预测是现代计算生物领域最重要的问题之一,而蛋白质二级结构预测是蛋白质高级结构预测的基础。目前蛋白质二级结构的预......
将数据库技术应用到蛋白质二级结构预测的样本集处理和分析上,建立了二级结构预测样本集数据库。以CB513样本集为例介绍了该数据库......