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我国的梨属(Pyrus L.)植物种质资源相当丰富,山西作为梨的主要产区之一也有很多品种。但由于梨属植物缺乏栽培种的野生种群、梨品种之间的形态差异较小等原因,形成了很多有争议品种,导致现有梨的新品种得不到有效的保护,因而对梨品种进行快速准确的鉴定,对促进我国梨种质资源的利用和品种鉴定具有重要的意义。(EST-SSR标记充分利用现有的信息数据,避免构建文库及测序而获得标记的繁琐步骤,开发的标记揭示的多态性较高,提供的信息量丰富。该标记已广泛用于物种分类、物种鉴定以及遗传多样性分析等研究中。)本研究选用24个山西梨栽培品种为研究材料,采用EST-SSR分子标记的方法分析梨品种间的遗传多样性,并构建其特有的指纹图谱。实验结果如下：1.采用正交设计筛选、优化及验证梨属植物EST-SSR标记中PCR反应体系及程序。为确定PCR反应的最佳体系,利用正交设计的实验方法,对梨属植物的PCR反应体系进行优化。最终确立梨SSR-PCR最佳的反应体系(10μL)为：1.0μL10×PCR Buffer TaqDNA聚合酶1.4U、Mg2+2.0mmol/L、 DNA模板50ng、dNTPs0.1mmol/L、引物0.5μmol/L。此体系在后续实验中得到验证。2.开发梨属植物EST-SSR标记引物,并进行筛选验证。利用已公布的1752条梨属植物EST序列,选取78对梨属植物的EST-SSR引物。采用这78对引物对24个梨品种进行扩增,共扩增出558个等位位点,其中有30对引物能扩增出336条大小在预期片段范围内,清晰的多态性条带,多态位点百分率达60.2%。PIC值变化范围在0.56-0.91,平均为0.75。其中,引物BRC0003、BRC0004、BRC00010和BRC00044这4对引物可以完全区分24个梨属品种。3.采用EST-SSR标记分析梨属植物的遗传多样性。聚类分析把24个梨品种分为5个类群。沙01和其余品种亲缘关系最远,中梨三号和苹果梨、硕丰梨为一个类群；阿巴特、红茄梨、早熟阿巴特、巴梨为一个类群,都属于西洋梨种；其余15个品种聚为一类。结果显示中梨三号和中华玉梨并不是同一品种,而玉露香梨和库尔勒香梨亲缘关系较近。4.采用EST-SSR标记构建出24个山西梨品种特有的指纹图谱,能够对梨属植物进行鉴定,为建立梨树植物指纹鉴定数据库积累科学依据；利用引物BRC0003、BRC00010和BRC00044构建了24个梨属植物材料的指纹图谱。为了直观方便对每一个梨属植物品种的鉴定,还利用10对核心引物构建了每一个品种的指纹图谱。(这句话还需要推敲,意思不是很清楚)