肠道微生物与宿主的营养、免疫和代谢密切相关,对于维持动物的正常生理活动方面起着重要作用。影响动物肠道微生物群落组成和多样性的因素很多,主要包括饮食情况、环境条件和季节变化等。鹤类是我国重要的保护生物,对生态环境变化敏感,是良好的环境指示物种。近年来随着环境污染、湿地破坏、栖息地碎片化等人为活动的影响,鹤类的种群数量急剧下降,亟需进行跟踪研究并采取有针对性的保护措施。本研究采用非损伤取样（Noninvasive sampling）、高通量测序技术（Illumina Hi Seq）和生物学信息分析等方法对济南野生动物世界冬季和夏季的丹顶鹤（Grus japonensis）、灰鹤（Grus grus）、蓑羽鹤（Grus virgo）、白枕鹤（Grus vipio）和灰冠鹤（Balearica regulorum）的肠道微生物进行研究,探讨5种鹤类肠道微生物群落结构差异和多样性差异,比较分析不同季节肠道微生物的变化,并深入分析产生差异的原因。主要研究结果如下:1.在冬季,5种鹤类肠道微生物的总体组成包括23个门、222个科、461个属,不同鹤类的肠道微生物在各分类水平的丰度表现出一定程度的差异性。在5种鹤类共有的OTUs比例为4.6%,共有的门科属比例分别为56.52%、53.15%、40.78%。在门水平上,厚壁菌门（Firmicutes）,变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、蓝细菌门（Cyanobacteria）是鹤类肠道微生物的优势菌门。在科水平上,优势菌科分别为乳酸杆菌科（Lactobacillaceae）、莫拉菌科（Moraxellaceae）、肠杆菌科（Enterobacteriaceae）、链球菌科（Streptococcaceae）、假单胞菌科（Pseudomonadaceae）、肠球菌科（Enterococcaceae）。在属水平上,乳酸杆菌属（Lactobacillus）、不动杆菌属（Acinetobacter）、假单胞菌属（Pseudomonas）是丰度较高的几个菌群。冬季5种鹤类肠道微生物的种类组成和群落结构具有显著差异（Anoism:R=0.35,P=0.011）。LEf Se分析显示灰鹤和蓑羽鹤的肠道微生物之间存在具有统计学差异的Biomaker,冬季这两种鹤类的肠道微生物组成存在显著差异。2.在夏季,5种鹤类肠道微生物的总体组成包括18个门,209个科、420个属,不同鹤类肠道微生物的多样性、丰富度和均匀度具有显著性差异。5种鹤类共有的OTUs比例为2.25%,共有的门科属比例分别为66.67%、37.50%、27.38%。在门水平上,鹤类肠道微生物的优势菌门是厚壁菌门（Firmicutes）,变形菌门（Proteobacteria）、蓝细菌门（Cyanobacteria）。在科水平上,优势菌科分别为乳酸菌科（Lactobacillaceae）、肠杆菌科（Enterobacteriaceae）。在属水平上,乳酸杆菌属（Lactobacillus）、Streptophyta属、乳酸链球菌属（Lactococcus）、埃希氏杆菌属（Escherichia）是丰度较高的几个菌群。夏季5种鹤类肠道微生物的种类组成和群落结构具有极显著差异（Anoism:R=0.89,P=0.001）。LEf Se分析显示5种鹤类肠道微生物之间存在数量不等的具有统计学差异的Biomaker,夏季5种鹤类的肠道微生物组成存在显著差异。3.对夏季和冬季5种鹤类粪便的混合样品进行高通量测序,共鉴定出24个门、228个科、484个属,两个季节均检测出的门科属比例分别为72.00%、89.04%、82.02%。丰度前三的菌门为厚壁菌门（Firmicutes）,变形菌门（Proteobacteria）、蓝细菌门（Cyanobacteria）,丰度前三的菌科为乳酸杆菌科（Lactobacillaceae）、莫拉菌科（Moraxellaceae）、肠杆菌科（Enterobacteriaceae）,丰度前三的菌属为乳酸杆菌属（Lactobacillus）、不动杆菌属（Acinetobacter）、链球菌属（Streptococcus）。夏季组和冬季组鹤类肠道微生物组间差异大于组内差异且差异极显著（Anoism:R=0.2873,P=0.001）。