背景:抑郁症是一种常见的精神疾病,且近年来的发病率不断增加。环境因素和遗传因素对抑郁症有一定程度的影响。但是,国内有关抑郁的全基因组关联分析（GWAS）的研究相对较少。因此,本研究的目的是探讨遗传因素对抑郁的影响程度,并利用GWAS研究探索与抑郁有关的基因单核苷酸多态性（SNPs）、基因及通路。方法:从青岛市双生子登记系统中选择符合纳入排除标准的成年双生子,研究对象的抑郁症状的得分情况通过老年抑郁（GDS-30）量表来评估。双生子的卵型可通过性别、ABO血型、及微卫星DNA基因扫描与分型技术进行逐步鉴定。使用Mx软件构建结构方程模型,根据最佳拟合模型估计抑郁的遗传度。使用Infinium Omni2.5Exome-8v1.2Bead Chip芯片进行基因分型,并使用IMPUTE2软件对未被分型的SNPs进行插补。在GWAS中,使用全基因组高效混合模型（Genome-wide Efficient Mixed Model Association,GEMMA）进行以SNPs为基础的分析,通过曼哈顿图显示与抑郁有关联的SNPs位点,采用VEGAS2（Versatile Gene-based Association Study-2）进行以基因为基础的分析,并使用PASCAL进行以通路为基础的分析。此外,我们进行了表达定量性状位点（Expression quantitative trait loci,eQTL）分析探索在大脑、甲状腺、胫骨神经和全血四种组织中的相关cis-eQTL。结果:本研究纳入了243对同卵双生子和139对异卵双生子,共382对双生子。采用382对双生子进行遗传度分析,139对异卵双生子进行GWAS研究。研究对象的年龄范围为33-80岁,中位数为50岁,四分位数间距为12岁,抑郁得分的范围为0-27分,中位数及四分位数间距均为7分。在遗传度分析中,由于同卵双生子的组内相关系数(r MZ=0.43)小于2倍的异卵双生子的组内相关系数(r DZ=0.25),故选用ACE模型。然后通过似然比卡方检验,最简原则和Akaike’信息准则确定AE模型为最优模型,最终得出抑郁的遗传度为43.79%（95%CI:33.87%-52.65%）。此外,本研究共有1,339,089个合格的SNPs位点用于GWAS分析。在以SNPs为基础的分析中,Q-Q图显示不存在人群分层现象。曼哈顿图显示没有超过显著性水平(P<5×10-8)的SNPs位点,但是发现了15个SNPs位点超过有建议关联水平(P<1×10-5),包括rs10851768、rs4776862、rs55795943、rs9260936和rs2861190等。尽管对未分型的SNPs进行插补后仍未发现有超过显著水平的SNPs位点,但是有56个SNPs位点超过有建议关联水平,其中13个SNPs位点与插补前重复。在以基因为基础的分析中,发现了1034个与抑郁名义上相关（P<0.05）的基因,包括TMEM257、SCNN1B、OR6N1等基因。以通路为基础的分析中,发现了626条生物通路与抑郁有关,主要包括全身性红斑狼疮通路（systemic lupus erythematosus）、烟酸和烟酰胺代谢通路（nicotinate and nicotinamide metabolism）和Xbp-1（S）激活伴侣基因通路（activation of chaperon genes by Xbp-1s）等通路。通过eQTL分析,我们发现有17个SNPs位点是在大脑、甲状腺、胫骨神经和全血等组织中与抑郁显著相关的cis-eQTL。而在前20位基因中,有14个基因在大脑、甲状腺、胫骨神经和全血这四种组织中的至少一种组织内存在与抑郁显著相关的cis-eQTL。结论:本研究表明,在青岛市双生子人群中,抑郁呈中度水平遗传。同时,本研究发现了一些与抑郁相关的SNPs位点、基因以及生物通路,为今后抑郁症的分子生物学研究提供了相关依据。