用SYBR Green Ⅰ实时荧光定量RT-PCR方法检测RHDV、RHDV2的初步研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenbenxia
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
兔病毒性出血症(Rabbit hemorrhagic disease, RHD)对养兔业来说是一种威胁很大的的烈性传染性疾病,由兔出血症病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus, RHDV)引起,主要侵害2月龄以上的青壮年兔,造成的发病率和病死率都非常高,让家兔养殖行业的经济效益大幅降低。从2010年开始,欧洲地区出现了兔出血症病毒变异型,又称兔出血症病毒2型(Rabbit hemorrhagic disease virus tape 2, RHDV2),可造成30日龄以下幼兔和免疫兔瘟家兔的死亡,这一情况引起了养兔业的广泛关注。鉴于兔出血症病毒出现的变异情况及新的流行趋势,本试验通过对比分析RHDV,RHDV2的结构蛋白基因VP60,分别对RHDV, RHDV2的SYBR Green I荧光定量RT-PCR检测方法进行了研究,以期为RHD的快速检测诊断和分子流行病学调查提供科学技术工具。根据NCBI上登录的RHDV2 VP60基因序列设计6对引物,人工合成靶基因。将靶基因纯化回收,通过连接、转化构建重组质粒pMD19-T-RHDV2。根据靶基因序列设计1对简并引物,以阳性质粒为模板进行荧光定量PCR扩增,建立关于RHDV2的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测方法,并优化反应体系,进行特异性试验、重复性试验和灵敏性试验。用建立的方法对实验室人工感染样品(7份)和临床采集样品(15份)进行检测。试验结果显示建立的RHDV2检测方法灵敏度高,特异性强,重复性好。该方法可检测的重组质粒pMD19-T-RHDV2的最低拷贝数为68个拷贝,该方法只能特异性的扩增RHDV2,对RHDV、兔巴氏杆菌、兔沙门氏菌、兔大肠杆菌和兔健康组织RNA的扩增结果均呈阴性,以阳性质粒为模板进行扩增得到的Ct值组内变异系数均小于0.8%,而该方法对RHDV人工感染样品和15份临床采集样品的检测结果均为阴性。通过比较分析NCBI上已登录的兔出血症病毒VP60基因序列,选择保守区设计一对特异性引物。提取RHDV阳性病料总RNA进行RT-PCR扩增,扩增出979bp大小的RHDV基因片段,并克隆到pMD19-T载体,构建重组质粒pMD19-T-RHDV。同时在扩增区内设计1对简并荧光定量PCR引物,目的片段大小为165 bp,以pMD19-T-RHDV为标准品进行荧光定量PCR扩增反应条件的优化和特异性试验、敏感性试验、重复性试验,建立了RHDV的SYBR Green I荧光定量RT-PCR检测方法。再利用建立的SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法对RHDV人工感染家兔(7只)进行检测并分析各组织器官的病毒含量,同时参照文献中的RT-PCR方法进行平行检测。试验结果表明建立的RHDV检测方法最低可检测的重组质粒pMD19-T-RHDV的拷贝数为81个拷贝,灵敏度优于RT-PCR方法。该方法只能特异性扩增RHDV, pMD19-T-RHDV2、兔巴氏杆菌、兔沙门氏菌、兔大肠杆菌和兔健康组织RNA的扩增均为阴性;以阳性质粒为模板进行扩增得到的Ct值在组内的变异系数均小于1.12%,说明该方法的敏感性高,特异性强,重复性好。对人工感染家兔各个脏器的检测结果表明脾脏的病毒含量最多,阳性检出率达100%,且可以根据各样品的Ct值计算出各脏器具体的含毒量,达到准确定量的效果。普通RT-PCR检测结果显示脾脏的条带最清晰,含毒量最多,与荧光定量PCR的检测结果基本相一致。
其他文献
《机械制图》是机械类各专业学生必须掌握的一门实践性较强的专业基础课,主要任务是培养学生具有一定的识读、绘制工程图样的能力及一定的空间想象能力。传统的教学模式是从二维到三维再到二维,由于学生的空间想象能力较差,学习起来比较吃力。教学实践表明,借助于三维CAD软件的三维实体造型功能,通过对工程形体的实体模型演示,把工程形体的抽象、静止的内容转换成形象、生动的立体模型图,采用先三维、后二维、再三维的模式
在仔猪日粮中添加不同剂量半胱胺,研究半胱胺对仔猪抗氧化酶活性、细胞免疫、体液免疫、肠黏膜免疫以及血清生长激素水平和胸腺和脾脏中生长激素受体(GHR)表达的影响,探索不同
高校图书馆图书“逾期罚款”之规定,既于《教育法》无据,也有违《行政处罚法》,更不符合《合同法》有关规定,很有反思之必要。 The provisions of college library books an
摘 要:通过对高职化工专业教学进行现状分析,结合高职的培养目标,针对目前存在的问题,提出了化工专业实践教学改革的内容及实施办法。  关键词:高职教育 化工专业 实践教学 教学教革    1.前言    高职化工类专业的培养目标,着眼于培养应用型高级技能人才。它强调以培养学生应用能力为主,掌握基础理论知识适度,使学生成为面向化工生产、管理、服务第一线的高素质劳动者和技术应用型人才。  近年来,随着我
γ-干扰素(IFN-γ)是机体内具有抗病毒、抗肿瘤和免疫调节功能的重要细胞因子。研究表明,内源性IFN-γ水平的高低在很大程度上可以反映机体的细胞免疫状态,因此对样本中的IFN
时间的光芒已经照亮了二十一世纪的天空。在高速奔驰的中国现代列车行进中,世界经济正趋向一体化,科技迅猛发展,日新月异。全球各种文化空前大交流,大融会。在这样的时代背景下,回顾中国的现代语文教育的历程,颇有感慨。  中国的历史悠久,中国的汉字承载着中国悠久的历史,对于中国的现代语文教育,自“五四”新文化运动废弃“文言”推广“白话”,建立新学堂推行新教育算起,途径叶圣陶先生起草的《1923年新学制》《初
黏膜免疫系统是广泛分布于呼吸道、消化道、泌尿生殖道黏膜以及一些外分泌腺体的淋巴组织,是执行局部特异性免疫功能的主要场所。黏膜免疫应答过程的分泌型免疫球蛋白A分子是
新一轮的新课程改革如火如荼地进行,新课程要求在课程结构、学习目标、教学方法等进行重大的变革。语文学科教学一定要以人的发展为本,服从、服务于人的全面发展。关注人是新课程的核心理念——一切为了学生的发展。  怎样才能适应新课改理念,赶上教育时代的潮流?我有下面几点看法:    一、改变传统的语文教学观,关注学生的情感体验    历史在发展,社会在进步,我们应用发展的目光来看新时代。语文教材所选的文章,