近年来,我国金融市场快速发展,股票市场和商品市场日益成为投资者进行大类资产配置的重要场所,股票市场和商品市场的联动性变化会直接影响到投资者构建投资组合,但目前较少有文献研究这两类市场之间的相关性。此外,在国内外复杂环境的综合作用下,我国经济政策存在许多不确定性,但目前少有文献研究经济政策不确定性对金融市场间相关性的影响,而我国金融市场常被诟病是“政策市”,经济政策的变动会对金融市场也产生影响,进而影响股票市场和商品市场之间的联动性,影响投资者进行投资决策。所以,研究股票市场和商品市场之间的联动关系以及经济政策不确定性对联动性的影响具有重要意义。股票市场和商品市场之间存在联动性的经济原理和机制主要可以从实体经济和金融市场两个角度进行分析。实体经济角度来看,主要的经济学理论包括通货膨胀效应、实际余额效应和成本调节效应等。金融市场角度来看,理论包括投资组合理论、羊群效应理论、金融传染理论等等。经济政策不确定性对股票和商品市场间联动性的影响同样可以从实体经济和金融市场两个角度进行分析。从实体经济角度来看,经济政策不确定性作为一种风险,根据资本成本理论、实物期权理论和预防性储蓄理论,经济政策不确定性增大时,会减少企业的投资和居民的消费,进而影响商品和股票的价格,最终影响二者的联动性发生变化。从金融市场的角度来看,可以用“流向质量”和“流出质量”的理论进行解释,当某个市场风险程度上升时,资金会流向风险程度更低的市场,因此,当经济政策不确定性发生变化时,投资者会将资金投向风险更小的那个市场,使两个市场之间的联动性发生变化。基于此,本文选择2004年6月1日至2021年1月31日的沪深300指数代表股票市场,选择南华综合指数以及四个南华期货一级分类指数代表商品市场,建立DCC-GARCH模型研究股票市场和商品市场的联动性。并在此基础上,分析经济政策不确定性对联动性的影响。首先使用格兰杰因果检验研究经济政策不确定性对联动性的影响,接着改变数据频率使用同样的方法研究四类细分的经济政策不确定性对股票和商品市场联动性的影响;最后建立MS-VAR模型,分析在不同区制下,各类细分经济政策不确定性对联动性的影响。本文的研究结论主要有:（1）在大多数情况下,股票市场和商品市场之间存在着正向的联动关系;（2）经济政策不确定性是股票市场和商品市场之间联动关系的格兰杰原因,但反过来却不一定成立;（3）不同细分经济政策不确定性对股票和商品市场之间联动性的影响不同,具体来说,经济政策不确定性对联动性的影响主要通过汇率与资本账户不确定性、财政政策不确定性、货币政策不确定性起作用,与贸易政策不确定性关系较小;（4）在不同区制下,经济政策对股票市场和商品市场之间的联动性并不相同。本文的研究结论对投资者和监管者都有一定的指导意义。