基于转录组测序对鸡胚抗氧化酶活性的研究

来源 :合肥工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sunjuanhuahard
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
鸡胚生长发育期间只能通过母鸡产蛋前在鸡蛋内沉积的营养物质来维持,且没有可以与外界进行代谢废物排出的器官,只能依靠自身来分解代谢产物,比如生长发育所产生的活性氧。胚胎在发育过程中,机体代谢速度加快,需要更多的氧来提供能量,同时会产生更多的活性氧,高水平的活性氧会造成蛋白质、脂质过氧化以及DNA损伤。此时存在于鸡胚中的第一道抗氧化防御线一超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化酶(GSH-PX)、过氧化物酶(POD)共同发挥作用来抵御活性氧。研究表明,生长发育过程中鸡胚不同组织中抗氧化酶活性是不断变化的,然而关于调控这些抗氧化酶活性变化的基因的鉴定及功能验证仍处于起步阶段。因此,本研究利用转录组测序技术筛选调控不同抗氧化酶活性的关键基因,从生物学角度阐明引起鸡胚发育过程中抗氧化酶活性变化的原因,并对筛选出来的关键基因进行功能验证。基于以上研究目的,本研究得到了以下3方面的试验结果:  1抗氧化活性鉴定:鉴定出鸡胚不同孵化期间,SOD活性高于GSH-PX和POD活性,其中以肝脏中活性最高,可以达到145.77±4.37U/mgprot。因此,以肝脏中的SOD活性作为筛选指标,采集孵化至第16d和第20d的肝脏组织用于后续的研究。  2转录组测序筛选关键基因:通过对孵化至16d和20d的鸡胚肝脏组织进行转录组测序,得到了57292698-65547680raw reads,过滤后得到了51868410-58937096clean reads,比对到参考基因组的reads均可达到79%以上。对样品间基因表达水平相关系数均大于0.97,设置阈值p<0.05,foldchange≥1,筛选了1154个差异表达基因,GO富集分析得到了1069个显著富集的GO terms,从其中筛选出了10条和抗氧化酶活性相关的GO terms。GO富集和KEGG通路分析表明GSTA2,GSTA4,MGAT1,GPX3和HAO2参与了谷胱甘肽代谢以及活性氧的产生,因此确定为影响抗氧化酶活性的关键候选基因。  3关键基因的功能验证:分离培养鸡胚肝实质细胞,合成针对GPX3基因的小RNA干扰片段,转染细胞48h后收集细胞检测酶活。结果发现转染转染效率可以达到70%,3条小RNA片段对GPX3基因的表达都有一定的干扰效果,其中GPX3-gga-714片段对GPX3基因的干扰效率最明显,达到了55.27±0.06%。此外,从蛋白水平来看,小RNA片段干扰后对酶活性有一定的影响,干扰之后,细胞中SOD、CAT活性分别增加(12.85±0.01)U/mgprot,(1.19±0.38)U/mgprot,GSH-PX、POD活性分别降低了(0.52±0.44)U/mgprot、(0.89±0.85)U/mgprot。  本研究首次通过转录组测序技术对孵化期间鸡胚肝脏抗氧化酶体系进行了研究,鉴定出胚胎发育过程中调控抗氧化酶活性的关键基因及其调控机制,为进一步研究鸡胚生长发育提供理论依据,对于提高鸡肉制品及蛋制品的营养价值和经济效益具有重要意义。
其他文献
自限温伴热带是一种理想的发热元件,是具有一定科研价值及市场推广应用价值的高新技术产品。这种产品最大的特点是能够根据环境温度的变化来自动的调节其发热功率,因此被广泛地应用于石油、化工及民用等领域。目前,这种产品在国内的用量非常大,仅国内生产该产品的企业就有几十家。在这些企业中,尤其一些中、小型生产厂家,产品的检测手段落后,多数是靠手工操表去检测产品的质量。随着基础材料的技术进步,自限温伴热带在国内将
  开关磁阻电机(SRM)以其控制灵活、结构简单、可靠性高、电气性能优良等优势,正逐渐成为继直交流调速系统之后出现的一种新型调速系统。 本文以开关磁阻电机核心控制策
本篇毕业论文来源于工程实践应用。文章就按GB1032电机试验方法国家标准研制具有专家分析功能的高压电机智能检测系统,进行了较为详细的叙述。 系统为了节省投资,兼顾高、低
我国是柿子的原产国和主产国,产量约占世界总产量的73%。柿果中的单宁含量远高于其它水果,是植物多酚的重要来源,但柿单宁的提取方法缺乏统一的溶剂提取条件;同时,柿果中高含量的单宁也是引发公众对食用柿子可能导致“胃柿石”担忧的重要因素,但目前关于“胃柿石”的研究主要集中在临床治疗方面,且治疗方法间存在矛盾,此外,公众对“胃柿石”的认识存在一些误区。本文以柿子为主要研究对象,旨在评估“胃柿石”的形成风险
本文建立了电力电子电路基于混杂系统理论的统一模型,该模型能够适用于参数辨识。并在此模型的基础上提出了一种能应用于故障诊断的参数辨识方法,该方法以最小二乘作为算法,能够实现参数的在线辨识。分别建立了六类DC/DC电路(包括运行在CCM和DCM工作模式)、三相PWM整流电路以及三相逆变电路的混杂模型,分析给出了上述几种电路的参数辨识算法。设计了Buck电路的参数辨识实验装置,通过对其滤波电感、滤波电容
传统的三相异步电机转子故障诊断方法主要是定子电流频谱分析法,这种方法存在着故障分量易被湮没等问题,故有必要联合多种信号对转子故障进行综合诊断。本文选取定子电流、径
电力系统市场化运行之后,输电损耗分摊成为一个基础理论问题,引起了广泛关注。目前,国内外学者已经提出很多解决此问题的方法,但是,这些方法都没有圆满地解决该问题,因此,需要进一步研究。 Naravan S.Rau于2001年提出了使用等值辐射网络进行损耗分摊的方法,为损耗分摊工作打开了一个全新思路。目前已经出现两种求取等值辐射网络的算法,经过研究分析,我们发现已有算法都存在一些问题。这些算法都没
永磁无刷直流电动机利用电子换相代替机械换相,不仅具有直流电动机的调速性能,而且体积小、重量轻、结构简单、维护方便、运行可靠、效率高,在许多领域都得到了广泛应用。本文是
  本文主要介绍了一种以串联谐振环节为基础的电流源型高频链逆变器。其主要特点包括:电路拓扑可以四象限工作,能量可以双向流动;所有开关元器件在谐振电流的过零点切换,可以实
随着国家一带一路的倡议,国内越来越多的工程建设单位走出国门进行各种各样的国际工程建设;面临着机遇,同时也要面临着挑战.鉴于国际工程项目的复杂性,一旦工程项目发生延误(