无论是从全球来看,还是从国内市场来看,医药制造业都有着极为广阔的发展前景,而研发创新活动对医药企业的生存和发展起到至关重要的作用。医药制造业研发创新活动往往依赖于政府,长久以来,政府补助与企业绩效之间关系都是学者关注的重点。政府补助能够鼓励企业进行研发创新,但是频频曝光新闻事件中,医药制造业企业净利润中政府补助占比惊人,很多企业纯粹依靠政府补助“输血”来维持“良好”的净利润或者依赖政府补助来减少企业亏损,真实的企业绩效究竟是否因为政府补助而得以提高存在疑问。这就促使我们思考政府补助是否完全发挥了促进创新和促进企业发展、提高企业自身实力和竞争力的作用。本文选取获取高额政府补助的医药制造业上市企业作为研究对象,利用实证方法,检验政府补助与公司绩效的关系,并探究在此过程中企业研发投入是否起到中介作用,以期对政府补助的应用效果以及作用机制得出实证结论。首先,本文利用国泰安数据库、Choice数据库以及Wind数据库中的基本数据发现我国医药制造业上市公司受到政府补助不仅金额高,且覆盖面广。基于理论基础和国内外已有研究结论,提出了政府补助和公司绩效之间存在着负相关的关系。然后,本文选择2012-2019年中国沪深两市医药制造业上市公司,共计249个有效样本、1751个数据点,研究本年政府补助、滞后1年政府补助对企业绩效的影响。研究得知本年政府补助对公司绩效有着负向作用,滞后1年政府补助对企业绩效也有着负向相关影响。同时,政府补助能够正向促进企业研发投入,即存在“诱导效应”,在此基础上,证实了企业研发投入确实起到中介作用。接着,依据上述回归分析的结果进一步利用数据包络模型（Data envelopment analysis,DEA）探究企业研发活动的效率。最后,本文从政府补助的政策制定、实施和后续监管的方面以及企业管理两个角度提出了针对性建议。