乌珠穆沁羊肉质相关基因SCD与CDC10的多态性及其与脂肪酸组成的关联性分析

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乌珠穆沁羊作为蒙古系绵羊品种之一,因具有肉质鲜嫩,营养价值较高等特点深受消费者的青睐。目前已有研究表明SCD和CDC10基因与脂肪酸(Fatty acid,FA)组成和脂肪沉积有关。SCD基因是饱和脂肪酸(Saturated fatty acid,SFA)去饱和成为不饱和脂肪酸(Unsaturated fatty acid,UFA)过程中的关键酶,影响FA的组成,进而影响肉的营养价值和风味;CDC10基因可通过调控细胞周期来影响肌内脂肪的沉积,进而影响大理石花纹肉的等级。由此推测SCD和CDC10基因可能是影响乌珠穆沁羊羊肉品质的重要候选功能基因。为了研究SCD和CDC10基因多态性与乌珠穆沁羊背部最长肌中FA组成的关联性,本研究首先测定244只乌珠穆沁羊背部最长肌中FA组成,分析各FA之间的相关性;利用直接测序技术挖掘12只乌珠穆沁羊的SCD和CDC10基因的多态性,再利用MassARRAY技术对244只乌珠穆沁羊的SCD和CDC10基因的多态性位点进行基因分型,进而分析各突变位点的遗传多样性及其与乌珠穆沁羊FA组份的关联性。结果如下:(1)测定乌珠穆沁羊背部最长肌中FA组份共发现30种FA,其中SFA与UFA各15种;分析FA间相关性发现,C13:0和C18:2n6t,C21:0和C20:3n6表现为完全正相关,MUFA和MUFA/SFA表现为完全正相关,EFA和PUFA与PUFA/SFA表现为完全正相关(P=1.00)。(2)挖掘SCD和CDC10基因的多态性位点结果显示,SCD基因上共发现4个多态性位点,分别是g.21032436G>A(3号内含子)、c.498G>A(4号外显子)、g.21032827A>C(4号内含子)和c.828C>T(5号外显子);CDC10基因上共发现5个多态性位点分别为,g.62910998C>T(启动子)、g.62868889T>C(3号内含子)、g.62843724T>C(5号内含子)、g.62835677A>C(6号内含子)和g.62812866G>A(12号内含子)。(3)SCD和CDC10基因遗传多样性分析结果显示,除SCD基因的c.498G>A位点之外,其余各位点在实验群体中均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。(4)SCD和CDC10基因的多态性与FA之间的关联性分析结果显示,g.21032827A>C位点的AC基因型个体所含C22:6n3显著高于AA基因型个体(P<0.05);c.828C>T位点的CT基因型个体所含C11:0和MCFA显著高于CC基因型个体(P<0.05),CC基因型的C14:0含量显著高于CT基因型个体(P<0.05);g.21032436G>A位点的AG基因型个体所含C17:1显著高于AA基因型个体(P<0.05)。g.62843724T>C位点的TT基因型所含C18:1n9t极显著低于TC基因型个体(P<0.01)。(5)生物信息学分析结果表明,SCD基因的c.498G>A位点和c.828C>T位点同义突变引起m RNA二级结构的变化,进而影响SCD基因的功能。综上所述,SCD基因的g.21032827A>C位点和g.21032436G>A位点,CDC10基因的g.62843724T>C位点均与乌珠穆沁羊背部最长肌中的UFA显著相关,可作为提升乌珠穆沁羊肉质品质的有效分子遗传标记,同时也为乌珠穆沁羊遗传改良提供科学依据。
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