我国民办教育作为对公办教育的补充,在发展初期不可避免会出现一些问题,而建立和完善民办高校的法人治理结构将是解决上述问题的根本途径。我国《民办教育促进法》及其《实施细则》对我国民办高校的法人治理结构已作了比较明确的规定,确定了民办高校实行董事会领导下的校长负责制。尽管如此,但现实中仍然存在着因产权不明晰而带来的某些不容忽视的问题。为此,本文认为,构建民办高校法人治理结构有其广泛的理论依据:现代高校自治及委托代理理论是民办高校法人治理结构的管理学理论依据;我国的有关法学理论及教育法规特别是《民办教育促进法》是民办高校法人治理结构的法学理论依据;权力制衡理论是民办高校法人治理结构的政治学理论依据。我国目前民办高校由于各种原因导致了产权方面的许多问题,主要包括:第一,出资人所有权与学校法人财产权不分;第二,所有权与经营权不分。正是由于这些产权问题的存在,导致了我国民办高校治理结构中的诸多问题,如董事长、董事会及校长之间的关系问题;董事会成员构成问题;监督机制缺失问题等。应当借鉴公司法人治理结构,针对这些现存的问题,构建权力机构、执行机构和监督机构相互制约的以权力制衡为核心的民办高校法人治理结构。