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目的：在超声引导下对卵巢巧克力囊肿患者进行介入治疗，对比治疗前、后患者血清中巧克力囊肿相关免疫因子CD36、NR4A1、HES1水平的变化，以评价介入治疗疗效。 方法：选取在超声引导下介入治疗符合本研究入选条件的9例巧克力囊肿患者，治疗前及治疗后3个月分别进行血清标本的采集，然后进行NimbleGen全基因组表达谱芯片检测，通过对巧克力囊肿介入治疗前、后血清中巧克力囊肿相关因子的基因功能和基因通路的分析，选出介入治疗前、后差异表达显著因子CD36、NR4A1、HES1，并对有显著意义的相关因子进行PCR验证。分析治疗前、后超声图像及血清中巧克力囊肿相关因子CD36、NR4A1、HES1表达差异及其与巧克力囊肿的相关性。 结果：通过NimbleGen全基因组表达谱芯片检测在众多治疗前、后差异表达因子中发现CD36、NR4A1、HES1是有显著意义的因子，在巧克力囊肿介入治疗后表达下调，差异因子CD36、NR4A1、HES1参与的基因功能与巧克力囊肿的发病机制具有相关性，经过PCR验证，定量证实介入治疗前、后这些因子下调是有意义的。 结论：CD36、NR4A1、HES1是与巧克力囊肿发病机制密切相关的差异因子。患者血清中CD36、NR4A1、HES1在乙醇硬化介入治疗后呈下调表达，具有从分子水平评价介入治疗疗效的价值。