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鸭遗传图谱的构建是重要经济性状基因座(QTL)定位及其主效基因克隆研究中不可缺少的部分,而后者又为鸭遗传改良提供理论依据。然而,至今未见关于鸭遗传图谱构建及QTL定位的研究报道。本文旨在通过构建鸭微卫星富集文库克隆大量微卫星DNA序列,利用克隆的序列设计引物,并通过PCR扩增及其扩增片段大小的分析,检测来源于两个北京鸭品系的三代群体基因型,在此基础上通过遗传连锁分析构建鸭第一张遗传图谱,并应用区间定位方法发现一些对生长、屠体及肉质性状具有显著作用的QTL。 本研究应用链亲和素捕捉方法构建了富集(CA)n、(CAG)n、(GCC)n及(TTTC)n重复类型的鸭混合型微卫星富集文库,序列测定结果表明,1181个随机克隆中832个含有10bp以上核心序列,571个克隆核心序列≥15bp,富集率为73.18%,平均插入片段长度为372.87bp;完全型、不完全型、复合型及其它类型微卫星的比例分别是65.29%、13.29%、8.25%及13.17%:完全型中(AC)n、(GCA)n、(GCC)n及(TTTC)n类型重复微卫星的比例分别是64.56%、12.81%、1.58%及5.96%;不完全型中上述四种重复类型微卫星的比例分别是70.69%、6.03%、13.29%及8.25%。 选择核心序列≥15bp的微卫星DNA序列,利用直接荧光标记或M13间接荧光标记的方法共合成300对引物,通过多重PCR反应条件的优化,筛选出了138对可用于大规模基因型分析的引物。根据优化好的PCR条件,选择12个全同胞家系包含31个F0、16个F1、224个F2个体进行全基因组扫描,并利用31个无相关个体F0代的基因型分析新微卫星位点的特性,结果表明,25个位点纯合,113个位点表现为多态,等位基因数为2-18个,平均为4.65个。113个多态位点杂合度为0.03-1.0,平均杂合度为0.48:PIC为0.03-0.97,平均PIC为0.46。 113个多态位点遗传连锁分析结果显示,28个未与任何标记连锁,85个分布住16个连锁群,平均、雄性及雌性图谱分别覆盖1110.7、928.7、1377.2cM;16个连锁群中,10个雄性图谱长于雌性图谱,3个雌性图谱长于雄性图谱,2个连锁群在雄性或雌性图谱中紧密连锁,而1个连锁群在平均、雄性及雌性图谱中均紧密连锁,16个连锁群雄性与雌性图谱差异为48.29%。 区间定位结果表明影响1-7周龄体重的QTL分布在1、4、6、10及16号连锁群,显著或极显著影响1-7周龄体重的QTL的个数均为4个:作用于7周龄体尺的QTL分布在2、3、4及14号连锁群,具有显著或极显著影响体尺的QTL个数分别为3个、1个;屠体性状则受1、2、3、4、6、7、10、11、12、14及16号连锁群QTL的作用,具有显著或极显著效应的QTL个数分别为3个、11个;肉质性状则受4号连锁群2cM处及11号连锁群0cM处和17cM处QTL的显著作用。