论文部分内容阅读
目的长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一类新发现的长度超过200核苷酸（nucleotide，nt）的调节性非编码RNA。最新研究发现，lncRNA与肿瘤的发生关系密切。通过分析lncRNA在胃癌组织及癌旁组织中的差异性表达，筛选出与胃癌发生发展密切相关的lncRNA，结合胃癌患者的临床病理因素进行分析，探讨胃癌相关lncRNA的临床病理意义，为胃癌的诊断提供新的候选肿瘤标志物。方法1.采用基因芯片检测胃癌组织与相应癌旁组织中lncRNA的表达谱差异，筛选出表达上调或下调超过4倍的lncRNA。2.生物信息学预测上述筛选出的胃癌相关lncRNA的靶基因。3.实时定量逆转录-聚合酶链反应（qRT-PCR）技术验证61对胃癌组织及相应癌旁组织中胃癌相关lncRNA的表达水平，比较其表达水平的差异性。4.结合胃癌患者的临床病理资料，通过统计学分析，探讨胃癌相关lncRNA与肿瘤大小、浸润深度、淋巴结转移、TNM分期、组织分级、血清CA72-4、CEA、CA19-9等临床病理因素的关系，初步阐明胃癌相关lncRNA的临床病理意义。结果1.采用lncRNA基因芯片技术，筛选出表达水平上调或下调超过4倍的lncRNA分别有10种和9种。2.利用生物信息学技术预测异常表达的19种lncRNA的靶基因，预测结果：AK054978的靶基因为RP1-177G6.2；FER1L4的靶基因为ERGIC3及SPAG4。结合文献资料，发现RP1-177G6.2、ERGIC3及SPAG4与多种肿瘤有关。3.qRT-PCR检测发现：在61例胃癌组织中，50例（81.97%）AK054978表达上调(P﹤0.0001)，56例（91.80%）FER1L4表达下调（P﹤0.0001)。4．本组胃癌组织中高表达的AK054978及低表达的FER1L4均与肿瘤大小、组织分级、浸润深度、淋巴结转移、TNM分期、脉管神经浸润等临床病理因素显著相关（P﹤0.05），与性别、年龄、肿瘤部位、血清CA72-4、CEA、CA19-9等因素无明显相关性（P﹥0.05）。结论通过基因芯片筛查及qRT-PCR检测，发现胃癌相关lncRNA-AK054978、FER1L4。与癌旁组织相比，胃癌组织中AK054978表达水平显著升高，而FER1L4表达水平显著下降。结合临床病理因素分析，发现肿瘤越大、分化程度越低、TNM分期越晚的胃癌患者AK054978的表达水平越高；与之相反，FER1L4的表达水平越低，提示AK054978、FER1L4可能与胃癌的发生发展关系密切，有望成为胃癌新的肿瘤标志物及分子靶点。