理论上讲,创新来源于两个方面,一是内部,即通过自主研发增加技术存量,实现自主创新;二是外部,即通过技术扩散和技术外溢实现技术创新的促进。在开放经济条件下,外国直接投资、国际贸易已经成为发展中国家获得先进技术、促进自主创新的重要渠道,也是发展中国家发挥后发优势的主要途径。本文通过理论研究、现状研究、实证研究,深入分析了基于FDI、进口和出口三种模式的国际化对我国自主创新影响及地区差异性,并在理论研究和实证研究的基础上,进一步分析了国际化模式影响我国及各地区自主创新的作用机制。通过研究分析,本文得出,FDI通过对核心技术的控制抑制了我国的自主创新;出口通过促进研发投入和技术扩散促进了自主创新;进口则是因为国外先进技术对中国技术进步的推动作用具有一定的时滞效应造成当前对自主创新的促进作用还不显著。对地区的差异性分析中,本文的结论是国际化三种模式对东部地区均有显著影响,其中FDI和进口对自主创新起抑制作用,出口对自主创新起促进作用;国际化的三种模式对西部地区自主创新均无明显的作用效果;国际化对中部的作用效果主要表现在出口对中部有一定的促进作用,其他两个因素的作用效果不明显。推究国际化对自主创新的地区差异性的作用机制,作者发现,这主要是由三个地区的市场化水平、科技进步环境等因素的差异引起的。本文提出了优化升级出口贸易结构,引导东部地区出口企业向中西部地区转移,提高引资的质量、转变引资方式,加快发展中西部地区经济,加快中西部市场化进程,缩小地区差距,加大教育与科研投入,吸引人才回流等相应政策建议。