预算管理是高校财务管理的核心内容，预算管理的水平，影响着学校的财务状况，关系着高校未来的长远发展。从1999年高校扩招以来，学校的规模不断扩大。为了满足高校的发展，所需的资金也越来越多。传统的预算管理模式只重视投入，不重视产出和结果，造成的资源的极大浪费及低效率，严重阻碍了高校的发展。高校要想获得长远的发展，必须改变传统的预算模式。绩效预算是一种强调产出和结果的预算，强调资金的使用效率和效益。在高校实施绩效预算，符合高校发展的内在要求，能够有效的提高财政资金的使用效率。本文在研究绩效预算的理论基础上，引出来绩效预算的内涵特征，指明了高校预算绩效改革的方向。绩效预算管理是一个复杂的系统，预算支出绩效评价和预算绩效管理是这个大系统的子系统。目前我国已经开始了绩效预算的探索，首先是预算支出的绩效评价开始的，部分地区已经开始了绩效评价的试点工作。本文首先设计了调查问卷来分析预算支出绩效评价的现状，并对预算支出绩效评价存在的问题提出了相应的改革的建议。并且提出了对预算编制、预算执行和控制、预算监督考核等各个环节进行绩效改革的思路，并做出了案例分析。针对S高校目前的预算管理的现状，按照预算绩效改革的要求，提出了相应的改革的方法，用于指导高校的预算。最后，提出了完善高校绩效预算管理配套制度的建议。高校实施绩效预算是一个循序渐渐的过程，必须建立相应的制度基础来规范和指导高校绩效预算，还要有相应的绩效预算的文化环境来促进绩效预算的实施。