女性系统性红斑狼疮患者皮肤微生物群落多样性研究

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研究背景系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种严重的自身免疫性疾病,常累及多器官系统且其临床表现多样,好发于育龄妇女。据报道,70~80%的SLE患者会出现皮肤症状,25%的SLE患者首发皮肤症状。然而,鉴别SLE患者的皮肤症状存在困难,因而容易延误SLE的诊断和治疗。皮肤作为人体最大的器官,不仅存在共生有益的微生物,也存在潜在致病的微生物。有研究提示,与健康人群的皮肤相比,皮肤微生物群紊乱与一些皮肤疾病和免疫性疾病有关。皮肤微生物群落的改变可能在自身免疫性疾病进程中发挥重要作用。尽管暴露于外部环境中,但在各个分类单元水平上,皮肤微生物群的结构和功能组成都处于稳定状态,且具有部位和个体特异性,这为不同疾病状态下皮肤微生物群落的探索提供了依据。目的比较SLE患者面部皮疹部位与不同对照人群皮肤微生物群差异,分析不同临床特征组SLE患者皮肤微生物多样性变化及组成差异,研究SLE患者皮肤微生物群中的差异菌与临床指标之间的相关性,发现SLE患者皮疹部位微生物特异性。方法本研究采用病例对照设计,收集女性SLE患者皮疹和非皮疹部位、玫瑰痤疮患者皮疹部位和健康对照的皮肤样本。采用16S r RNA测序方法检测皮肤微生物,分析SLE患者皮肤微生物的多样性和结构。采用Wilcoxon秩和检验和线性判别分析效应量分析SLE患者与对照相比出现的皮肤微生物群落及功能注释差异,并分析不同临床症状下SLE皮肤微生物差异。采用Spearman相关性分析衡量SLE患者皮肤菌群差异物种与实验室指标的相关性。结果收集女性SLE患者面部皮疹部位和无皮疹部位、玫瑰痤疮患者面部皮疹部位和健康对照面部的皮肤样本各20例进行微生物检测。SLE患者皮疹部位微生物多样性和组成发生改变。与三组对照组相比,厚壁菌门(Firmicutes)、杆菌纲(Bacilli)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、拟杆菌目(Bacteroidales)、拟杆菌纲(Bacteroidia)、梭菌纲(Clostridia)、梭菌目(Clostridiales)、假单胞菌目(Pseudomonadales)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)等在SLE皮疹部位富集。基于京都基因与基因组百科全书数据库,发现SLE皮疹部位微生物的遗传信息处理、复制与修复、翻译、核苷酸代谢、能量代谢和核糖体通路增加且存在统计学意义,而异源生物降解和代谢的代谢通路减少。在低活动度SLE组中疣微菌科(Verrucomicrobiaceae)和气球菌科(Aerococcaceae)丰度增加;高活动度组SLE组中生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae)、拟杆菌科(Bacteroidaceae)、柄杆菌科(Caulobacteraceae)和假单胞菌科(Pseudomonadaceae)丰度增加。并且柄杆菌科(Caulobacteraceae)与SLE疾病活动度指数2000(Systemic lupus erythematosus disease activity index-2K,SLEDAI-2K)呈正相关(r=0.50,P=0.025),与补体3呈负相关(r=-0.58,P=0.007);气球菌科(Aerococcaceae)与SLEDAI-2K(r=-0.52,P=0.020)和免疫球蛋白G(r=-0.46,P=0.043)呈负相关;Dechloromonas与血沉(r=-0.58,P=0.007)和抗双链DNA(r=-0.58,P=0.007)呈负相关。Kingella与SLEDAI呈负相关(r=-0.49,P=0.027),而与免疫球蛋白A呈正相关(r=0.55,P=0.012)。结论本研究揭示了女性SLE患者皮肤微生物多样性及组成的变化,并且部分代谢功能及通路出现异常。从差异皮肤微生物入手,可能以全新角度为进一步探索SLE诊断和治疗提供线索。本研究对SLE患者皮肤微生物进行了初步探索,期待未来更大样本量的研究进一步探索SLE皮肤微生物的重要功能作用。
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