大兴安岭地区部分种DNA条形码研究

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:xy0382
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DNA条形码技术是利用一段标准的DNA片段快速、准确的识别、鉴定物种的新技术,是传统分类学的有效补充。本研究利用植物DNA条形码技术完成野外采集到的未知样品的识别及鉴定工作,本研究还专门以大兴安岭地区的木本植物为研究对象,筛选适合区系植物DNA条形码研究的DNA条形码。在研究中利用自己改进的植物DNA提取技术,进行DNA提取。研究成果如下:  1、植物组织中含有大量多糖、酚、酯等次生代谢产物,要从中提取高质量的DNA比较困难。针对这一情况,本研究提出一种改良CTAB法提取植物DNA,并以10种常见植物为实验材料,分别用改良CTAB法(mCTAB)与常用的四种植物DNA提取试剂盒提取植物DNA。结果表明,改良CTAB法提取的DNA产率高,质量较好,PCR扩增成功率较高,成本显著低于DNA提取试剂盒的成本,可有效用于植物DNA提取。  2、利用DNA条形码技术对22个未知样品进行物种识别及鉴定,经过DNA提取,PCR扩增,数据处理及分析等操作,8个未知样品能初步鉴定到种,9个未知样品鉴定到属,5个未知样品鉴定到科。  3、42个禾本科未知样品中,经过DNA提取,PCR扩增,数据处理及分析等操作,5个未知样品能够准确鉴定到种,8个未知样品初步鉴定到种,29个未知样品鉴定到属。  4、以大兴安岭地区木本植物为研究对象,评估在植物区系水平上3个叶绿体基因matK、rbcL、ycf1及1个核基因片段ITS的引物通用性及物种鉴定成功率。通过PCR扩增及测序成功率,序列变异,种内种间遗传变异,Barcoding Gap检测,Wilcoxon秩和检验,物种鉴定成功率等方面进行比较、分析,最终得出结论:ycf1基因片段是理想的区系植物DNA条形码,matK和ycf12个基因片段可以作为候选DNA条形码。
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