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乳腺癌占全部女性癌症的17.1％,位于中国女性癌症发病率首位.尽管目前根据乳腺癌分子分型采用的个体化治疗策略使乳腺癌治疗取得了阶段性突破,但是肿瘤异质性、耐药、转移等问题依然阻碍我们进一步提升临床疗效.单细胞转录组测序是一项能在单细胞水平上进行无偏倚、高通量、高分辨率全转录组学分析的新技术.该技术能以单细胞分辨率分析肿瘤内部基因表达特征,对认识乳腺癌具有不可替代的作用.就单细胞测序技术在肿瘤异质性、肿瘤微环境、转移、耐药等方面的应用进行综述,以期更加深刻地了解该技术并为乳腺癌研究提供全新思路.