人类PolⅡ启动子的识别

来源 :生物化学与生物物理进展 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ac8297090

【摘要】

：

依据基因启动子区和非启动子区碱基分布的特征,应用基于多样性增量的二次判别分析(IDQD),对人类polⅡ启动子进行识别,识别精度达到90%以上的水平,优于其他已发表的(包括SVM分

【作者】

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吕军罗辽复

【机构】

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内蒙古工业大学物理系,内蒙古大学物理学系

【出处】

：

生物化学与生物物理进展

【发表日期】

：

2005年12期

【关键词】

：

启动子多样性增量二次判别函数转录起始位点 promoter increment of diversity quadratic discriminant

【基金项目】

：

中国科学院资助项目，内蒙古自然科学基金

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依据基因启动子区和非启动子区碱基分布的特征,应用基于多样性增量的二次判别分析(IDQD),对人类polⅡ启动子进行识别,识别精度达到90%以上的水平,优于其他已发表的(包括SVM分类器等)识别算法.使用IDQD算法也能对转录起始位点(TSS)进行较准确的预测,10-fold交叉检验结果的敏感性和特异性分别为86%和91%.这些结果表明IDQD是一个有效的分类器.

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