论文部分内容阅读
【目的】
外泌体存在于大部分体液中,它的内容物包含多种能够反映疾病生理病理状态的细胞特异蛋白和核酸分子。环状RNA(circRNA)是一类结构稳定的环形RNA分子,不易被降解。因此外泌体circRNAs具有作为疾病分子诊断标志物的潜力。本研究的目的是通过筛查冠心病患者血浆外泌体中特异性高表达的circRNAs,探讨这些血浆外泌体circRNA作为冠心病分子诊断标志物的潜在用途。
【方法】
通过exoRNeasySerum/PlasmaMidiKit分离血浆外泌体RNA。采用circRNA测序分析了来自冠心病患者和健康对照血浆样本中外泌体circRNAs的表达水平。然后利用荧光定量RT-PCR在两家医院(佛山市人民医院和广东医科大学附属医院)的临床样本中重复验证候选circRNAs的差异表达。最后,通过受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)分析评估外泌体circRNAs作为冠心病分子诊断标志物的效能。
【结果】
RNA测序结果显示,在冠心病组和健康对照组中有355个circRNAs的表达水平具有显著性差异,其中164个circRNAs在冠心病中表达上调,191个circRNAs在冠心病中表达下调。基于表达差异倍数>4,P<0.05的筛选标准对候选生物标志物进行验证。荧光定量RT-PCR验证结果表明,在两家医院的验证样本中,环状RNAhsa_circ_0005540在冠心病患者组中显著升高。在联合hsa_circ_0005540和FraminghamHeartStudy风险因素(FHS RFs)之后,ROC分析的曲线下面积(Area Under Curve,AUC)为0.853(AUC=0.853;95%置信区间[CI]=0.799-0.906,P<0.001),灵敏度为0.810,特异性为0.765。
【结论】
本研究分析了冠心病患者和健康对照组中差异表达的外泌体circRNAs,发现环状RNAhsa_circ_0005540在冠心病患者中显著上调,且联合风险因素后AUC达0.853,表明血浆外泌体中hsa_circ_0005540具有作为冠心病生物标志物的潜力。
外泌体存在于大部分体液中,它的内容物包含多种能够反映疾病生理病理状态的细胞特异蛋白和核酸分子。环状RNA(circRNA)是一类结构稳定的环形RNA分子,不易被降解。因此外泌体circRNAs具有作为疾病分子诊断标志物的潜力。本研究的目的是通过筛查冠心病患者血浆外泌体中特异性高表达的circRNAs,探讨这些血浆外泌体circRNA作为冠心病分子诊断标志物的潜在用途。
【方法】
通过exoRNeasySerum/PlasmaMidiKit分离血浆外泌体RNA。采用circRNA测序分析了来自冠心病患者和健康对照血浆样本中外泌体circRNAs的表达水平。然后利用荧光定量RT-PCR在两家医院(佛山市人民医院和广东医科大学附属医院)的临床样本中重复验证候选circRNAs的差异表达。最后,通过受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve, ROC)分析评估外泌体circRNAs作为冠心病分子诊断标志物的效能。
【结果】
RNA测序结果显示,在冠心病组和健康对照组中有355个circRNAs的表达水平具有显著性差异,其中164个circRNAs在冠心病中表达上调,191个circRNAs在冠心病中表达下调。基于表达差异倍数>4,P<0.05的筛选标准对候选生物标志物进行验证。荧光定量RT-PCR验证结果表明,在两家医院的验证样本中,环状RNAhsa_circ_0005540在冠心病患者组中显著升高。在联合hsa_circ_0005540和FraminghamHeartStudy风险因素(FHS RFs)之后,ROC分析的曲线下面积(Area Under Curve,AUC)为0.853(AUC=0.853;95%置信区间[CI]=0.799-0.906,P<0.001),灵敏度为0.810,特异性为0.765。
【结论】
本研究分析了冠心病患者和健康对照组中差异表达的外泌体circRNAs,发现环状RNAhsa_circ_0005540在冠心病患者中显著上调,且联合风险因素后AUC达0.853,表明血浆外泌体中hsa_circ_0005540具有作为冠心病生物标志物的潜力。