2021年中央一号文件指出:“要突出抓好农民合作社和家庭农场两类经营主体,加大对运行规范的农民合作社扶持力度,推进农民合作社质量提升”。可见,国家非常重视农民合作社等新型农业经营主体的高质量发展。此外,农业生产合作社作为农民合作社的一种重要形式,有益于推动我国农业适度规模化经营和农业产业现代化发展。因此,对农民生产合作社经营风险的分析和防范研究对提升其经营管理水平和实现高质量发展具有十分重要的理论和现实意义。本文运用文献综述法、田野调查法、实证分析法等研究方法;基于规模经济理论、风险管理理论、制度变迁理论等经济学、管理学等学科的相关理论;结合贵州省124家农业生产合作社的调研数据,一是从市场风险、管理风险、技术风险、自然风险和政策风险等5个方面构建贵州省农业生产合作社经营风险评估指标体系,利用因子分析方法对其进行测算;二是从政策支持、经济环境、社会化服务、技术环境、经营者特质等5个方面构建贵州省农业生产合作社经营风险影响因素体系,使用结构方程模型对其进行实证分析。研究结果表明:影响贵州省农业生产合作社经营风险的因素中,政策支持作为最关键的外部因素对农业生产合作社经营风险存在直接影响;经济环境作为具有支撑力量的外部因素对农业生产合作社经营风险存在直接影响;社会服务环境和技术环境作为比较重要的外部因素对农业生产合作社经营风险存在间接（部分）影响;合作社经营者的个人特质作为最重要的内部核心因素对农业生产合作社经营风险存在直接影响。依据研究结果,本文提出要加强农业生产合作社的引导扶持、优化农业生产合作社的市场经营环境、改善农业生产合作社的社会服务环境、提高农业生产合作社的内部管理水平等的政策建议。