公共卫生应急管理体系是保障国家安全、公民身体健康的重要保障制度。自上世纪80年代以来,随着劳动力要素、资本要素大量流出,我国农村存在医疗卫生公共品供给不足问题,公共卫生事件应急管理体系逐步形成了“重城市,轻农村”的城乡二元结构。新型冠状病毒疫情暴露出我国农村乡村建设、公共卫生管理体系薄弱的短板,这些问题都亟需完善。乡村公共卫生体系建设是实现共同富裕、健康中国战略、乡村振兴的基础和支撑条件。本研究基于新冠肺炎疫情影响背景,以福建省农村作为研究对象,使用《福建省统计年鉴》等统计数据,应用乡村应急管理制度理论、多中心治理理论、协同治理理论、多元化治理理论等,以及在把握相关文件精神及内涵的基础上,构建福建省农村突发公共卫生事件应急管理机制理论框架,使用因子分析方法对福建省九地市农村突发公共卫生事件应急管理能力进行评价,分析各地市在农村应急管理能力的优劣势,并选取典型案例——福建省莆田市仙游县和平村进行调查研究与深入分析。首先,本研究回顾中央政府层面对突发公共卫生事件的应急管理机制设计情况与内涵。其次,进一步分析福建省在面对新型冠状肺炎疫情时采取的应急管理机制措。再次,本研究使用因子分析方法量化评价福建省九地市农村应急管理能力,得出结论:当前福建省应急管理能力与经济发展水平相挂钩,在空间维度上呈现“南部较优、北部居中、西部次之”的总体特征;其次各地市在应对突发公共卫生事件时管理机制不够全面、缺乏系统的顶层设计。其中,福州市、厦门市、泉州市表现较优,三明市、宁德市、南平市表现尚可,莆田市、龙岩市、漳州市表现较差。其中,三明市的医疗改革、下沉基层的卫生体制发挥了一定作用。此外,本研究以莆田市和平村作为个案研究对象,该村恰好是2021年9月福建省新冠疫情爆发的源头村庄之一,分别从治理主体政府、医疗机构、村民参与三个维度深入剖析其应急管理机制,该村一定程度上能够较好调动多元主体参与应急管理当中来,但未能发挥其在地化、本地化的高校师生参与度,医疗等公共品供给不足、救助物资配套不完备等问题。最后,本研究提出相应优化路径,提高乡村医疗卫生院供给能力;重视公共卫生学科发展,提高基层医疗卫技人员人力资本;提高农村居民医保参保率;建立应对重大公共卫生事件的舆情应对机制;完善乡村基础设施建设等。本研究可能存在的边际贡献是:一是本研究基于多中心治理理论、协同治理理论、乡村应急管理制度理论等,构建“基层政府-医疗机构-农村群众”的多主体、系统性分析框架;二是本研究为提高农村应对突发公共卫生事件能力进而提升乡村治理现代化水平,推动农村“管理”向农村“治理”的转变,提供经验证据上的支持。