微小RNA单核苷酸多态性与胃癌发病及预后特征的关联研究

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiazaikankan
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目的:胃癌是世界最常见恶性肿瘤,其死亡率在肿瘤中排名第二位,在中国,每年约有300,000人死于胃癌。尽管诊断及治疗的进步,胃癌病人诊断时仍然多已处晚期,且进展期胃癌患者的预后很差。MicroRNA(miRNA)是一类长度约为22nt的非编码单链小分子RNA,通过形成RNA诱导沉默复合体(RNA induced silencingcomplex,RISC)与靶基因3端非翻译区(untranslated region,UTR)互补结合,引起mRNA的切割降解或翻译抑制等,从而影响靶基因的表达。  在目前的研究中,我们收集了中国北方汉族人群中571例胃癌术后患者福尔马林固定的石蜡包埋组织(Formalin-fixed Paraffin-Embedded Tissue,FFPET)提取的DNA样本,并收集匹配的571例健康个体外周血提取的DNA样本,利用MALDI-TOFMS进行基因型分析,目的为研究miR-148a、miR-148b、miR-152基因单个SNPs位点及其构成的单体型与胃癌易感性、临床病理特征及预后的相关性,以寻找功能性SNPs作为预测胃癌侵袭能力及预后的分子标记,这对胃癌的防治具有重要的意义。  方法:病例组标本来源为571例胃癌患者术后石蜡包埋正常胃组织,对照组标本来源为年龄性别与病例组1∶1匹配571名健康人外周血。基因组DNA提取:福尔马林固定的石蜡包埋组织应用QIAamp(@)DNA FFPE提取试剂盒(德国)提取DNA,外周血DNA提取应用TaKaRa全基因组DNA提取试剂盒,依说明书描述操作。基因分型:我们使用基质辅助激光解析串联飞行时间质谱仪(Matrix-assistedLaser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry, MALDI-TOF MS)方法进行基因分型,针对每一个SNP分别设计正向引物、反向引物、延伸探针,为确保基因分型的准确性设计阴性对照、室内质控标准品对照,以及随机选取样品做为重复实验复核。基因型分析的操作人员不知道所检测标本的病例或对照属性。统计分析:统计分析用R软件及SPSS软件进行。应用了x2检验,非条件性logistic回归模型。  结果:miR-148b基因rs12231393位点与胃癌发病风险相关,携带C等位基因的个体相对于TT基因型的个体胃癌发病风险降低。miR-148b基因rs11170877位点与胃癌发病风险相关,带G等位基因的个体相对于AA基因型的个体胃癌发病风险降低。miR-148b基因rs12231393位点、rs11170877位点与胃癌的病理特征和预后均没有显著相关性。miR-148b基因rs12231393位点、rs11170877存在较强的连锁不平衡关系,构成TA和CG两个主要单体型。miR-148b的rs12231393及rs11170877两个单核苷酸多态位点构成的单体型TA与胃癌的易感性显著相关,携带TA单体型的个体发生胃癌的风险更高。miR-148b的rs12231393及rs11170877两个单核苷酸多态位点构成的单体型与胃癌的病理特征及预后没有显著相关性  在前期分析中发现,miR-152基因rs12940701位点与胃癌淋巴管癌栓相关,CC基因型携带者相比于T等位基因携带者更容易发生胃癌淋巴管癌栓。miR-152基因rs12940701位点在分层分析中发现,在淋巴结转移、浸润深度较深(pT3-pT4)胃癌患者中,携带C/C更容易发生淋巴管癌栓。miR-152的rs2240119和rs12940701两个SNP之间存在强连锁不平衡关系,构成TC,TT及CC三个主要单体型。miR-152的rs2240119和rs12940701两个单核苷酸多态位点构成的三个主要单体型与胃癌的易感性、病理特征均没有显著相关性。  miR-148a基因rs4719839位点与胃癌预后相关,G等位基因携带者相比于AA基因型携带者预后不好,总体生存期较短。miR-148a的六个SNP rs4719839,rs735316,rs6977848,rs4000713,rs78741986及rs4722551存在强连锁不平衡关系,构成ATTGTT, GTTGTT, ACGACC和ACGATC四个常见单体型。miR-148a六个SNP位点rs4719839,rs735316,rs6977848,rs4000713,rs78741986及rs4722551构成的四个常见单体型与胃癌的易感性没有显著相关性。miR-148a单体型与胃癌肿瘤大小这一病理特征相关,携带GTTTGT单体型的个体肿瘤较大的风险增加。miR-148a基因rs4719839基因型可能与miR-148a表达相关,携带AA基因型的患者miR-148a平均表达量高于携带G等位基因的患者的平均表达量,但是没有显著统计学差异,尚需要大样本验证。  结论:我们的研究利用大样本病例对照研究,评价了miR-148a、miR-148b、miR-152单核苷酸多态与胃癌发病及预后特征的相关性。我们发现了miR-148b基因单核苷酸多态位及单体型点与胃癌发病相关,miR-152基因单核苷酸多态与胃癌淋巴管癌栓这一病理特征相关, miR-148a单核苷酸多态位点与胃癌的预后后显著相关,单体型研究中发现miR-148a单体型与胃癌肿瘤大小相关。miR-148a基因单核苷酸多态rs4719839与miR-148a表达相关存在一定相关性,携带AA基因型的患者miR-148a平均表达量高于携带G等位基因的患者的平均表达量,但是没有显著统计学差异,尚需要大样本验证。
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