以DNA介导的大肠杆菌与链霉菌组装探究水平基因转移

来源 :天津大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ytcjy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
水平基因转移是生物进化的重要途径之一,目前已作为成熟工具被应用于生物底盘改造、重要天然产物的异源表达等。链霉菌可产生丰富的天然产物,常被用作异源表达宿主。接合转移是水平基因转移的方式之一。目前一些有重要价值的非模式链霉菌接合转移效率较低,无法顺利进行遗传改造,因此需要对接合转移过程进行进一步探究和优化。植物凝集素是一种糖蛋白,可以与细菌表面的糖基特异性结合,从而修饰在细菌表面。本研究利用植物凝集素将DNA链引入到细菌表面,通过DNA链的配对引导细菌的粘附聚集,构建了大肠杆菌与链霉菌的组装方法,从而为探究大肠杆菌与链霉菌的水平基因转移过程提供新的研究策略。本课题主要研究结果有:(1)成功构建了4株表达红色荧光的大肠杆菌,2株表达绿色荧光的链霉菌和1株表达蓝色荧光的链霉菌。用于测试接合转移效率的红色荧光质粒为6583 bp,基因片段为711 bp。(2)测试得到一组接合转移效率较稳定的模式菌:供体大肠杆菌ET12567和受体天蓝色链霉菌Streptomyces coelicolor A3(2),接合转移效率可稳定在10-4左右。(3)探究了供体与受体用量以及植物凝集素修饰细菌表面对接合转移的影响。结果表明,孢子用量的改变会导致接合效率呈现规律性变化。孢子用量为1×10~4时接合转移效率最高,为(5.3±0.5)×10-4。孢子用量为1×10~4时接合转移效率为零。植物凝集素修饰大肠杆菌和链霉菌表面对接合转移无显著抑制作用。(4)应用植物凝集素将互补DNA单链分别引入大肠杆菌与链霉菌表面。荧光显微镜表征表明,DNA链能够介导大肠杆菌与链霉菌孢子的聚集,且随着细菌表面植物凝集素-DNA共轭物浓度的增大,细菌的聚集程度增加。10倍理论最大量植物凝集素-DNA共轭物(1.5×10~6个Con A-DNA修饰一个大肠杆菌,6.3×10~6个WGA-DNA修饰一个链霉菌孢子)介导的接合转移效率最高,为(3.3±0.5)×10-4。本研究验证了植物凝集素修饰细菌表面不会对接合转移产生明显的抑制作用。后续引入的8 bp DNA链能够有效介导大肠杆菌与链霉菌孢子的组装聚集,证明我们成功构建了一种实现革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌组装的方法。本方法为控制大肠杆菌和链霉菌在接合转移过程中的距离提供了新手段,后续可通过调整DNA链长度以及细菌表面的DNA链数量,对接合转移过程进行进一步探究,为提高接合转移效率提供新工具和新信息。
其他文献
近年来,超分子自组装的研究引起了越来越多的科研人员的兴趣,超分子自组装是利用多种非共价键通过弱作用力自发地形成有序聚集体结构的一种方法。超分子自组装由于操作方便、原料易得等优点已经广泛应用于生物工程、环境保护以及光电催化等领域。在配位和超分子化学中,具有五个潜在结合位点的丙二酰脲化合物是非常典型的多功能配体,具有较高的研究价值和应用潜力,但是人们对此类配体的聚合物形式的研究还相对较少。因此,本文在
学位
传统高分子材料给人们提供无数便利的同时,也给环境带来诸多压力,如严重的“白色污染”问题。在此背景下,急需加快可降解生物基高分子材料的发展。尤其是以聚乳酸(PLA)为代表的生物基聚酯,因其具有良好的力学强度、生物相容性、透明性和阻隔性等优势,是近年来最具发展前景的生物基材料,有望替代降解缓慢的石油基塑料制品,在新型环保包装材料方面具有广阔的发展前景。然而,PLA自身脆性严重和抗冲击性差的问题严重阻碍
学位
随着数字信息的快速增长,DNA分子成为大规模数据存储的新型潜在材料,为解决巨大的数据存储问题提供了可能性。DNA信息存储包括体内存储和体外存储,目前体内存储容量远小于体外存储系统;另外在体外存储中,由于许多因素(如DNA序列的GC含量、片段长度和DNA聚合酶)导致PCR扩增偏差,对大型DNA文库的低偏好扩增是一个挑战。本文针对体内存储容量小及体外存储存在扩增偏差的问题进行了相关研究。首先,我们将编
学位
尼莫地平是一种典型的难溶性药物,溶解度差导致口服生物利用度低,体内吸收波动大。研究表明,纳米晶体能够有效改善难溶性药物在水中的溶解度,从而提高体内吸收。本文以粒径为指标对湿磨法制备尼莫地平纳米混悬液的工艺条件进行优化,通过SEM和PXRD检测方法考察尼莫地平纳米晶体的特性。以尼莫地平粗混悬液作为对照,对尼莫地平的溶解度、尼莫地平纳米混悬液的体外释放以及体内药代动力学进行研究。以尼莫地平原料药粗粉片
学位
许多疾病的发生都与核酸的突变有关,可以通过检测核酸进行疾病的诊断和治疗。因此开发具有高灵敏度和特异性的核酸检测技术是生命科学、临床测试、生物安全性、基因分型和流行病学的关键研究课题。其次,控制全球传染病如寨卡病毒、登革热病毒、2019-nCoV等的传播需要检测工具,这些工具必须灵敏度高,特异性强、费用低、操作简单且可在现场快速部署等等。如今,已经开发出许多方法用于核酸检测,如PCR技术和测序技术。
学位
以电活性微生物为核心的微生物电催化系统(MES),在能源、环境、化工等多个领域获得广泛应用。其中,由于过程清洁、费用低廉,采用MES处理生物质能源木质纤维素正在成为行业热点研究。但是,由于模式产电菌的底物谱范围窄,木质纤维素作为组成相对复杂的化合物难以被MES高效转化。尽管,研究人员采用代谢工程策略拓宽了产电菌的可利用底物范围,但是繁重的工程化改造为产电菌带来的代谢负荷、排异效应极大限制了产电菌自
学位
CRISPR系统作为细菌和古细菌的适应性免疫系统,如今已经在细菌、真菌和哺乳动物细胞中被开发为可编程的基因编辑工具。理论上,CRISPR系统能靶向任何DNA序列并进行切割,但实际应用会受到PAM区、脱靶效应、蛋白大小和细胞毒性等因素的限制。因此CRISPR系统的优化一直是现在的研究热点,大多数的蛋白改造技术已经被利用在Cas(CRISPR-associated)蛋白的改造中,但DNA改组技术(DN
学位
硼是一种重要的工业原料,广泛应用于陶瓷、半导体、超导体和冶金等行业。11B和10B是两种稳定的硼同位素,自然丰度分别为80.22%和19.78%。11B和10B在核工业和医学等领域都有非常重要的应用,这两种同位素实际应用的关键是将它们分离到较高的浓度。相较于化学交换精馏法分离硼同位素,色谱法具有吸附容量大、回收率高、操作过程简单、成本较低等优点。四氧化三铁磁性纳米粒子对硼同位素具有优良的吸附分离能
学位
天然产物是制药工业的重要来源,链霉菌是天然产物的资源宝库。迄今为止,约三分之二的天然抗生素和一系列抗癌、抗蠕虫、抗真菌和免疫抑制药物均来源于链霉菌。测序技术的发展揭示了链霉菌富含天然产物生物合成基因簇,然而,在传统的实验室条件下,这些基因簇大多处于沉默状态,因此,开发沉默基因簇激活技术对于天然产物的挖掘是有必要的。目前,基于CRISPR-Cas系统的一系列基因编辑工具在沉默基因簇激活上具有重要的地
学位
为解决化石燃料引起的环境污染和能源短缺问题,开发清洁可再生的能源刻不容缓。与风能、太阳能、潮汐能等易受自然环境影响的间歇性能源相比,氢能因其环保、可储存的特性,具有更大的应用潜力,而且碱性条件下的电解水产氢拥有高质量、无污染、来源丰富等优点,被认为是极具前景的产氢方法之一。因此,为了提高电解水效率,设计性能优良、价格低廉的电催化剂变得尤为重要。在析氢反应(HER)中,氢氧化物Ni(OH)2的Ni2
学位