基于外泌体环状RNA的口腔鳞状细胞癌术前淋巴结转移预测模型构建

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangdong1231
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的探讨口腔鳞状细胞癌(Oral squamous cell carcinoma,OSCC)患者淋巴结转移的影响因素,筛选和验证影响口腔鳞状细胞癌淋巴结转移的外泌体环状RNA(Circular RNAs,circ RNA)并构建术前淋巴结转移风险预测模型。方法1.回顾性分析506例OSCC患者颈部淋巴结转移的相关规律,并按3:1的比例将患者随机分成建模组(387例)和验证组(119例)。采用非条件Logistic回归模型评估计算建模组各影响因素与OSCC淋巴结转移风险关系的比值比(Odds ratio,OR)及其95%可信区间(Confidence interval,CI)。2.根据多因素分析结果筛选出建模组中口腔鳞状细胞癌淋巴结转移的影响因素,用于构建术前预测淋巴结转移风险的列线图(Nomogram)模型,并在建模组中评估模型预测性能以及使用验证组进行内部验证。3.采用circ RNA表达谱芯片扫描技术,在4例OSCC淋巴结转移患者与4例未转移患者术前血浆外泌体中筛选可能与淋巴结转移相关的circ RNA,在4对OSCC淋巴结转移患者术前与术后血浆外泌体中筛选可能来自于肿瘤的circ RNA,两者取交集后挑选在两者中同时呈显著差异表达的circ RNAs用于下一步的研究。4.采用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,q RT-PCR)方法在77例OSCC患者血浆外泌体中对筛选出的circ RNAs进行验证,并探讨circ RNAs的表达水平与OSCC淋巴结转移风险的关系。最后挑选与OSCC淋巴结转移有显著关系的circ RNA与对淋巴结转移有影响的临床特征构建Circ RNA-based nomogram模型。结果1.OSCC患者经病理学检查发现淋巴结转移率达到40.12%,颈部淋巴结转移主要发生在Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ区,其中Ⅱ区淋巴结转移率最高(62.50%),而Ⅳ和Ⅴ区则较少累及。2.建模组多因素分析结果显示:活检分化程度为鳞状细胞癌较鳞状上皮病变的患者发生淋巴结转移的风险更大(OR=2.62,95%CI:1.38-4.98),颊癌及口底癌患者发生淋巴结转移的风险明显高于牙龈癌(OR=3.32,95%CI:1.20-9.20;OR=3.80,95%CI:1.13-12.80),MRI报告的淋巴结阳性的患者发生淋巴结转移的风险更大(OR=7.39,95%CI:3.55-15.40),此外,MRI报告的最大肿瘤直径≥2.6cm OSCC患者发生淋巴结转移的风险是<2.6cm患者的2.13倍(95%CI:1.26-3.60)。白细胞水平偏低与OSCC患者的淋巴结转移风险存在正相关关系(OR=5.46,95%CI:1.48-20.09)。3.基于建模组多因素分析结果筛选出的变量构建术前预测淋巴结转移风险的Nomogram模型,ROC和DCA结果显示Nomogram模型较MRI具有更好的预测性能以及更高的临床应用价值。4.芯片结果共发现7条肿瘤来源且与淋巴结转移有关的血浆外泌体circ RNA,其中上调2条,下调5条。通过circ RNA芯片表达丰度,引物设计效果,最终筛选出以下3个差异倍数最明显的外泌体hsa_circ RNA_047733、hsa_circ RNA_024144、hsa_circ RNA_403472用于下一步分析。5.q RT-PCR验证结果显示hsa_circ RNA_047733在OSCC淋巴结转移阳性组的表达水平低于淋巴结转移阴性组,表达水平较高的外泌体hsa_circ RNA_047733可以降低OSCC发生淋巴结转移的风险。6.Circ RNA-based nomogram模型在区分度、校准度、拟合优度、临床应用价值等方面均优于基于患者临床特征构建的Nomogram模型。结论1.活检分化程度、发病部位、MRI报告肿瘤最大径、MRI报告的淋巴结状态、白细胞水平是OSCC患者淋巴结转移的预测因子,基于以上5个指标构建的Nomogram模型对淋巴结转移风险预测性能良好。2.高表达的hsa_circ RNA_047733可以降低OSCC淋巴结发生转移的风险,在基于患者临床特征构建的Nomogram模型的基础上纳入血浆外泌体hsa_circ RNA_047733能够有效改善Nomogram模型对淋巴结转移风险的预测能力。
其他文献
目的1.观察乳兔原生破骨细胞及大鼠单核诱导破骨细胞(osteoclast)典型特点。2.探究体外环境下ZOL(zoledronic acid,唑来膦酸)对成骨细胞(osteoblast),巨噬细胞(Macrophage),骨髓间充质干细胞(BMSC)增殖分化的影响。3.探讨局部及全身运用唑来膦酸对SD大鼠骨缺损修复中成骨-破骨的影响方法:1.新生新西兰大白兔骨髓细胞培养法观察原生典型破骨细胞的形态
背景:口腔癌是一类发生于口腔的独特类型癌症,已被确定为全球最常见的恶性肿瘤之一,其中口腔鳞状细胞癌约占口腔癌的90%。口腔癌的恶性程度高,患者5年平均生存率低于60%。口腔癌的治疗手段以手术疗法为主,原发灶的完整切除对肿瘤的治疗至关重要,目前外科医生主要还是根据手术过程中对肿瘤的视诊及触诊来评估原发灶切除范围。虽然可以利用术中切缘冰冻病理对切缘进行评估,但术中冰冻病理只能研究切缘的一小部分,这容易
目的:褪黑素是主要由松果体产生的神经内分泌激素。已有研究表明,褪黑素可以通过其受体发挥抗肿瘤作用。然而,褪黑素的抗肝癌作用及机制尚未明确。本研究旨在通过分析褪黑素受体及合成代谢基因(褪黑素相关基因)在肝癌中的异常表达,识别与肝癌发生和预后相关基因,为探索褪黑素抑制肝癌的具体机制提供理论依据。方法:首先,在三套肝癌数据集TCGA-LIHC、LIRI-JP和GSE14520中分别识别褪黑素相关基因在癌
雷达辐射源信号分选与识别的结果直接影响到雷达对抗情报的质量,近年来得到该领域研究人员的高度重视。该技术的性能高低取决于两大核心要素,即识别特征参数和分类器。然而,由这两大核心要素构成的识别系统的效能却是不得而知的。因此,对雷达辐射源信号识别效能评估的深入研究是非常有必要且具有实际意义的。鉴于现有的雷达辐射源信号识别效能评估方法存在指标权重求解不合理、评估方法自身受限、决策风险高等普遍问题,本文固定
目的:本项系统性评价及Meta分析旨在评价(牙合)垫对颞下颌关节紊乱综合征的治疗效果。方法:本项系统性评价及Meta分析依据PRISMA指南进行报道。检索以下四个数据库:美国医学索引数据库(Medline via Pubmed)、科学引文索引数据库(Web of Science)、生物医学研究文献数据库(Embase)和摘要引文数据库(Scopus)。最后检索时间为2021年2月。本项目纳入标准为
随着经济的发展和自动化技术的进步,制造或物流等行业的仓储设施与技术不断革新,仓库的自动化程度逐渐提高,对仓储管理系统的应用也日益广泛。近年来,一些企业希望仓库在节约管理成本同时保持较高的存储能力,双伸位立体库应运而生,其布局方式有效提高了地面利用率和存储率,被迅速应用和推广,而如何设计双伸位仓库的管理系统也成为了关注的热点。目前,较多仓储管理系统存在功能不适用、脱离实际等问题,且传统的货位分配和作
为无人机设计一个合理的公共航路,能够保证有效监管无人机群体飞行、合理设置空港和物流转运点、保障低空空域安全和无人机自身飞行安全。然而现实中预计行驶在公共航路上的无人机在执行飞行任务时容易受到各种因素的影响,使其偏离预设的公共航路。为了尽量减少已偏离的无人机在公共航路外受到的不利影响,加强对意外偏离现象的处理能力,需要保证无人机从偏移点尽早回归公共航路。深度强化学习是目前无人机在自主导航问题中实现自
氧还原反应(ORR)是新一代能量转换装置(如金属-空气电池、燃料电池等)中的关键反应之一。该反应存在动力学过程缓慢且反应过程复杂的问题,影响了整个能量装置的转换效率。当前用于氧还原反应的催化剂主要是铂基催化剂,但是其存在储量少、价格高、耐久性差且易中毒的问题,因此需要高效、稳定、价廉的非贵金属催化剂推动这些能量转换装置的商业化应用。过渡金属-氮/碳材料(M-N/C)因其出色的催化活性、优异的稳定性
近年来,随着科学技术的飞速发展,足不出户就可以拥抱世界、精彩生活。比如,获取全世界正在发生的事、居家远程学习和办公、可以看直播、在家就可以购物点餐买菜等等。伴随着人们越来越高的通信网络需求,通信网络在超高速、大带宽、超远距离的方向上不断取得突破。此外,当今社会获取信息的方式也多种多样,各类信息铺天盖地的展现在我们面前,在使我们的工作生活丰富便捷的同时,国家、企业、个人的信息安全也严重收到威胁。信息