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目的:本研究以临床科研信息共享系统为载体,釆集真实世界慢性肾脏病患者的临床信息建立数据库,基于中医症状相似性,探索慢性肾脏病网络分型的宏观临床表型特征与微观分子特征,为同病异治理论提供科学依据,以用于提高慢性肾脏病个体化诊断、治疗水平和改善预后。
方法:以慢性肾脏病症状多样性为切入点,采集临床电子病历数据,基于规则处理的数据库,构建慢性肾脏病症状相似性网络。整合患者的临床表型信息,采用BGLL算法对症状相似性网络进行分型(亚组)划分,形成慢性肾脏病亚组症状群,通过表面富集分析,总结各亚组的中药及合并疾病情况,从而形成慢性肾脏病亚组的临床表型特征。同时利用亚组合并疾病信息从人类疾病数据库Malacards中获得这些疾病的基因,利用DAVID数据库(the Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery)对每个亚组进行KEGG富集分析,从而获得每个亚组分子特征。
结果:基于患者相似性网络,我们得到了9个慢性肾脏病模块(M0-M8,代表慢性肾脏病患者亚组),其中,前4个模块(M0、M1、M2、M6)的患者数量占总数的90.23%,说明慢性肾脏病患者症状的多样性和相对集中性。其次,我们确定了各亚组疾病的分子特征,表明慢性肾脏病患者中医症状多样性存在其内在的分子机制依据。
我们发现每个亚组除了有慢性肾脏病基本症状外,具有不同的临床表型及分子特征,M0患者以言语不利、进食呛咳、神昏为主要症状,中药特征以天竺黄、制远志、石菖蒲为主,分析其证候为肝肾阴虚、痰浊上扰,主要的通路是PI3K-Akt通路;M1患者以恶心、口苦、呕逆为主要症状,中药特征以紫苏叶、麸炒白术为主,分析其证候为脾肾气虚、湿浊内蕴,主要的通路是Toll样受体通路;M2患者以腰酸痛、尿短、大便干结为主要症状,中药特征以酒大黄、土茯苓、六月雪、石韦为主,分析其证候为肾虚湿热、瘀血阻络,主要的通路是2型糖尿病相关通路;M6患者以胸部憋闷、短气为主要症状,中药特征以红参、炒葶苈子、麦冬为主,分析其证候为气阴亏虚、水饮凌心,主要的通路是T细胞代谢通路。
结论:基于中医症状相似性网络对慢性肾脏病亚组进行研究有一定的实用性,这种“症状群-证候-通路”的数据挖掘模式,从分子层面能够解释中医“同病异治”理论,将中医药宏观表型与微观分子生物学相结合,拓宽了临床诊疗思路。
方法:以慢性肾脏病症状多样性为切入点,采集临床电子病历数据,基于规则处理的数据库,构建慢性肾脏病症状相似性网络。整合患者的临床表型信息,采用BGLL算法对症状相似性网络进行分型(亚组)划分,形成慢性肾脏病亚组症状群,通过表面富集分析,总结各亚组的中药及合并疾病情况,从而形成慢性肾脏病亚组的临床表型特征。同时利用亚组合并疾病信息从人类疾病数据库Malacards中获得这些疾病的基因,利用DAVID数据库(the Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery)对每个亚组进行KEGG富集分析,从而获得每个亚组分子特征。
结果:基于患者相似性网络,我们得到了9个慢性肾脏病模块(M0-M8,代表慢性肾脏病患者亚组),其中,前4个模块(M0、M1、M2、M6)的患者数量占总数的90.23%,说明慢性肾脏病患者症状的多样性和相对集中性。其次,我们确定了各亚组疾病的分子特征,表明慢性肾脏病患者中医症状多样性存在其内在的分子机制依据。
我们发现每个亚组除了有慢性肾脏病基本症状外,具有不同的临床表型及分子特征,M0患者以言语不利、进食呛咳、神昏为主要症状,中药特征以天竺黄、制远志、石菖蒲为主,分析其证候为肝肾阴虚、痰浊上扰,主要的通路是PI3K-Akt通路;M1患者以恶心、口苦、呕逆为主要症状,中药特征以紫苏叶、麸炒白术为主,分析其证候为脾肾气虚、湿浊内蕴,主要的通路是Toll样受体通路;M2患者以腰酸痛、尿短、大便干结为主要症状,中药特征以酒大黄、土茯苓、六月雪、石韦为主,分析其证候为肾虚湿热、瘀血阻络,主要的通路是2型糖尿病相关通路;M6患者以胸部憋闷、短气为主要症状,中药特征以红参、炒葶苈子、麦冬为主,分析其证候为气阴亏虚、水饮凌心,主要的通路是T细胞代谢通路。
结论:基于中医症状相似性网络对慢性肾脏病亚组进行研究有一定的实用性,这种“症状群-证候-通路”的数据挖掘模式,从分子层面能够解释中医“同病异治”理论,将中医药宏观表型与微观分子生物学相结合,拓宽了临床诊疗思路。