自然资源是人类经济社会发展的物质基础,需要通过法律规范加强对其管理和保护。我国《宪法》《民法典》等现行的自然资源法律法规已相对完善,自然资源国家所有权制度是我国现行的一项重要制度,而如何行使该权利一直是自然资源国家所有权实现的核心问题。从实践来看,虽然国家也在不断探索,但是由于立法的不足等原因,我国的自然资源国家所有权行使仍然存在诸多问题。因此,要进一步从理论方面明晰现有的理论论争,反思实践中的问题,进而促使我国自然资源国家所有权行使问题的不断完善。在处理自然资源国家所有权行使的问题时,必须明确该权利的构成。自然资源作为该权利中的一个基本概念,虽然立法中并无明确界定,但可依照其特征确定其内涵,并在此基础上明确国家所有自然资源的范围。自然资源国家所有权的主体是“国家”和“全民”,但是以国务院为权利行使的代表;其客体包括宪法中规定的七类属于国家所有的自然资源;在内容上,该权利包括占有、使用、收益和处分的积极权能以及权利受到损害时的消极权能,即物权请求权。自然资源国家所有权的法律性质决定了其行使的不同,虽有不同观点,但是公权私权混合说更加符合现实需求。自然资源国家所有权的行使以法律授权为基础,目前在宪法、民法典和各自然资源单行法中明确了所有权行使的法律依据,形成了相对完善的法律法规体系。从实践来看,在该权利的行使中,形成了国务院代表国家统一行使、国务院各部门和地方政府实际行使权利等行使方式的既有路径。此外,国家也在积极探索委托代理机制的试点,以推动形成合理有效的自然资源国家所有权的行使模式。但是在自然资源国家所有权行使中,依然存在自然资源国家所有权行使的授权不足,自然资源国家所有权行使混乱,自然资源国家所有权行使过度引发侵害私人利益、产生生态破坏、环境污染等问题。这主要是由于自然资源国家所有权行使的立法不足,缺乏对自然资源国家所有权行使的约束与指引,自然资源国家所有权的权能不明确,国家所有权行使机制难以满足现实需求,自然资源国家所有权行使的配套制度不足等原因导致。因此,要完善自然资源国家所有权行使制度,就需要健全所有权行使的规范体系,明确自然资源国家所有权行使的原则,完善自然资源国家所有权能,规范自然资源国家所有权的委托代理机制,完善委托代理机制的配套制度,以实现自然资源国家所有权行使的制度重构。