犬星状病毒荧光定量RT-PCR方法的建立及应用

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犬星状病毒(Canine astrovirus,CAst V)能引起犬呕吐、腹泻、发热等症状,对犬的健康造成威胁,其主要感染幼犬,在世界各个国家不同地区皆有流行,分布广泛。目前针对CAstV的检测方法有:电子显微镜技术、半巢式RT-PCR方法、荧光定量RT-PCR方法、巢式RT-PCR方法、下一代测序技术、RT-PCR技术等。本研究的目的是建立针对CAst V的荧光定量RT-PCR检测方法,为CAstV的检测和流行病学调查提供快速、灵敏的方法;用建立的方法对成都地区犬的临床样本进行分子检测,为该病的防控提供理论依据。本研究取得以下成果:1.成功建立了检测CAstV的荧光定量RT-PCR方法。该方法具有良好的特异性、灵敏性,CAstV的最低检测限为8.46×10~1 copies﹒μL-1,同时具有良好的可重复性。2.本实验样本是2020年10月至2022年1月由成都市的宠物医院和收容所提供的健康或者有肠道症状的各个年龄阶段的犬肛试子粪便样品共334份,其中有肠道症状样本185份,临床健康样本149份。在对334例犬肛拭子的分子检测结果表明,CAstV的荧光定量RT-PCR方法总阳性率为18.56%(62/334),普通RT-PCR方法的总检出率为10.48%(35/334),两种方法之间差异极显著(P<0.01)。建立的荧光定量RT-PCR方法比普通RT-PCR方法CAstV检出率高,更加灵敏。3.感染相关因素分析表明,CAstV的感染风险与犬的健康状况、年龄有关。CAstV在肠道症状样本中检出率为27.57%(51/185),无肠道症状样本中CAstV检出率为7.38%(11/149)。结果显示肠道症状样本中CAstV的检出率与无肠道症状样本存在极显著差异(P<0.01),说明CAstV的感染与犬的腹泻疾病的发生密切相关;CAstV的感染在不同年龄的犬中存在显著差异,低幼龄的CAstV检出率显著高于成年犬(P<0.05),表明CAstV的感染风险与犬的年龄有密切关系;不同品种、免疫状况、性别的犬对CAstV的感染差异不显著(P>0.05)。本研究建立的对CAstV的荧光定量RT-PCR检测方法,使得CAstV的诊断和检测更加特异、灵敏、可靠;对成都部分地区CAst V的感染情况进行分子检测,进一步丰富该病的流行病学资料,为该疾病的诊断和防控提供理论和技术支持。
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