基于iTRAQ技术小鼠呼吸机相关性肺损伤的蛋白质组学研究

来源 :海军军医大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaodehuwei123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究目的:机械通气(mechanical ventilation, MV)是危重病患者呼吸支持的重要手段,也是全身麻醉过程中必备条件之一。机械通气的基本目标是保证肺部通气和缓解呼吸窘迫。在危重病领域,急性呼吸衰竭(acute respiratory failure, ARF)是机械通气的主要适应症。机械通气的应用使更多ARF患者受益,大大降低了ICU住院患者的死亡率。同时,机械通气技术在麻醉领域中的应用推动了现代麻醉的迅速发展,避免了麻醉药物的呼吸抑制作用给患者造成的威胁。然而,随着呼吸机的广泛应用,在为重症患者与全麻患者提供生命支持和保障的同时,临床医师们逐渐注意到机械通气也给部分患者造成了损害,加重了原有的肺损伤,使病情恶化。甚至在某些因肺外原因应用机械通气的患者中,原本健康的肺组织也会随着机械通气的应用而出现不同程度的肺损伤。随着研究的深入,已将机械通气导致的肺的改变称为呼吸机相关性肺损伤(ventilator-induced lung injury, VILI)。VILI包括机械伤和生物伤,最终导致大量细胞因子及炎症介质释放,引起肺部甚至全身其他脏器损伤。目前对呼吸机相关性肺损伤的发生机制尚未完全阐明。如何有效防治VILI,特别针对生物伤的预防和治疗,仍是困扰临床医生的主要难题之一。
  纵观现有的研究,大多专注于从点出发探究VILI的发生和发展机制,尚未有明确结论。然而,人体作为一个有机整体,随着生命过程的进行,内外环境也是不断变化和调节的。其中就包括作为生物功能执行者——蛋白质,其质与量的变化将最终导致生物功能的改变,甚至疾病的发生。机械通气时机体的内环境发生改变,也必然导致执行相关功能的蛋白质出现变化。因此,从整体角度出发可能是探究VILI发病机制的新思路。
  随着蛋白质组(proteome)的概念以及蛋白质组学(proteomics)的诞生和发展,人们有了从整体角度出发研究VILI时全部蛋白质变化的工具。随着生命科学的迅猛发展,科学家们不仅仅满足于对蛋白质组的定性研究分析,同时对蛋白质的定量研究也提出了更高的要求。同位素标记技术即相对和绝对定量同位素标记(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术的诞生,使人们可以对全部蛋白质进行准确定量分析。因此,本研究拟从整体蛋白质谱变化角度出发,探究VILI的发生机制,寻找潜在的治疗干预靶点。
  目前,各种肺保护性通气策略的提出有效降低了VILI的损伤程度,但仍然无法预防VILI的发生和病情进展。VILI并非由单一因素导致,而是多种复杂因素共同作用的结果,过大的潮气量是导致VILI的主要原因之一。我们拟通过比较大潮气量(hightidal volume, HV)及小潮气量(low tidal volume, LV)通气后肺组织的蛋白质表达谱的差异,探究VILI的机制,从差异蛋白中寻找可能的治疗切入点。
  此外,机械通气所致的肺损伤可被视为一种物理性损伤,尤其是在机械通气的早期。而另外一类是以LPS诱导肺损伤为代表的生物性损伤,也是常见的急性肺损伤之一。两类肺损伤的始动因素不同,但最终均导致肺内炎性介质的产生并释放。因此,我们的研究应用基于iTRAQ技术的蛋白组学分析,希望通过比较物理性及生物性这两大类肺损伤的蛋白质谱变化,找到防治物理性肺损伤即VILI的突破点,从另一个角度探究以VILI为代表的物理性肺损伤的机制。
  研究方法:本研究以小鼠为研究对象,运用iTRAQ技术,分析大潮气量(HV)组和小潮气量(LV)组小鼠肺组织蛋白质谱的变化,筛选差异蛋白质;比较以MV诱导为代表的物理性肺损伤(HV组)与以LPS诱导为代表的生物性肺损伤(LPS组)小鼠肺组织蛋白质谱的变化,筛选与物理损伤相关的差异蛋白。通过对差异蛋白进行生物信息学分析,了解这些差异蛋白所参与的生物过程及相互作用关系,从而探究VILI的发生机制,寻找可用于诊断或治疗靶点的生物标记物。通过Western blot检测,验证目标蛋白在各种肺损伤模型小鼠肺组织中的表达情况。
  结果:通过基于iTRAQ的定量蛋白质组学技术,本次研究总共鉴定了3273种蛋白质用于进一步研究。HV 组和Con 组比较鉴定出差异表达蛋白( differentially expressed proteins, DEPs)126种,包括58种表达上调的蛋白质和68种表达下调的蛋白质。LV组和Con组比较鉴定出67个DEPs,包括36个上调的蛋白质和31个下调的蛋白质。LPS组和Con组中鉴定出176个DEPs,包括139个上调蛋白和37个下调蛋白。GO分析及KEGG分析均显示HV组与LV组富集模式相似,而LPS组则呈现与之不同的模式。我们找到14种差异表达蛋白在LV组和HV组中表现出相同的趋势,而LPS组表达没有变化,且这些蛋白质的倍数变化随着潮气量的增加而增加,可作为VILI特有的潜在的生物标志物。经创新途径分析(ingenuity pathway analysis, IPA),鉴定出的位居前4位的典型途径,与VILI发生密切相关。经过分析,选定LAMC2、HSPG2和ITGB2进行western blot检测,结果显示:LAMC2仅在小潮气量通气时下调;HSPG2仅在物理性肺损伤模型中下调;ITGB2仅在小潮气量通气时未显示出明显表达变化,在大潮气量通气和气管内滴注LPS时均显著上调。3种蛋白在各组中的表达情况与蛋白组学结果趋势一致。
  结论:本课题证明了使用基于iTRAQ的定量蛋白质组学技术来鉴定VILI小鼠和正常对照组中的差异表达蛋白质的可行性。HBB2,COL4A1,FGB,FGG,LAMB2, LAMA3,GPLD1,LAMB3,FGA,HSPG2,PZP,ITIH4,PLAC8和MUP1在LV组和HV组中显示相同的变化趋势,并且在LPS组中没有变化。最重要的是,这些蛋白质的变化随着潮气量的增加而增加,这表明这些蛋白质可能是VILI的潜在特异性标志物和治疗靶点。这些蛋白质的IPA分析途径和网络分析确定了前4个经典途径和前两个网络,这可能将帮助我们更好地理解VILI的致病机制。
其他文献
期刊
背景:缺血性脑卒中发病率高、死亡率高、致残率高,严重危害人类健康,在我国是仅次于癌症的第二大致死性疾病。近年来的研究指出,心脏外科、神经外科、血管外科患者围手术期脑卒中发病率高达5.5%~9.7%。许多的临床研究表明,缺血性脑卒中是围手术期脑卒中最主要的分型,而与手术麻醉相关的缺血性脑卒中则被公认为围术期严重的并发症之一。  大脑血流供应障碍引起缺血、缺氧。缺血区的神经元由于氧气和能量缺乏导致不可
感染,特别是严重感染,依然是临床危重病患者诊治过程中的关键和困难之处。控制不佳的严重感染会诱发感染性休克、多脏器功能障碍等等一系列严重并发症,甚至导致患者死亡。急性呼吸窘迫综合征(ARDS)多由各种感染、多发伤、严重创伤、大剂量输血等情况诱发,其中感染是最主要的原发病。肺内感染以及肺外组织感染均可诱发ARDS。多数ARDS患者起病突然,病程进展迅速,危及生命健康。革兰氏阴性菌(G-)、革兰氏阳性菌
噪声性耳聋是最常见的耳聋类型之一,是由于暴露于有害噪声,引起的以内耳损伤为主要病理表现的感音神经性耳聋。既往研究显示多种病理机制参与噪声性耳聋的发生发展,近年来发现耳蜗炎症反应可能是噪声性耳聋的又一个重要致病机制,为治疗噪声性耳聋提供了一条可能的途径。本研究围绕噪声暴露后引起耳蜗炎症反应进行深入研究,主要关注噪声是如何引起耳蜗炎症反应,也就是耳蜗炎症反应的起始阶段。既往研究发现,一般组织炎症反应的
【研究目的】  脓毒症是指由于机体对感染的反应失调而导致危及生命的器官功能障碍。多项流行病学调查显示,全球每年大约有3 150万例脓毒症患者,并可能导致530万例患者死亡。脓毒症以高发病率和致命性受到广泛关注,早期的干预治疗非常必要。  中性粒细胞是数量最多的参与固有免疫应答的细胞。病原体侵入机体时,中性粒细胞通过趋化因子的作用,与血管内皮细胞黏附,迅速移行至感染部位,通过吞噬、脱颗粒及呼吸爆发等
学位
学位
研究目的:急性带状疱疹是由水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus,VZV)感染所致,其主要特点为簇集水泡,沿一侧周围神经群集带状分布伴有明显神经痛。带状疱疹后遗痛(post-herpetic neuralgia,PHN)是指皮损消退后疼痛仍持续存在的慢性疼痛综合征,美国神经病学会(the American Academy of Neurology, AAN)将皮损消退后疼
学位
目的急性呼吸窘迫综合征(Acute Respiratory Distress Syndrome,ARDS)是临床常见的危重症,死亡率高。ARDS患者的重要特征是重力依赖性肺水肿,目前PiCCO监测的血管外肺水是最准确的肺水肿评价指标,不仅可以判断肺水肿的严重程度,也能够鉴别肺水肿的病因,但PiCCO是一项有创措施,会造成患者一定的风险。随着床旁超声技术在急危重症领域的迅速发展,肺部超声在急危重症领
学位
[研究目的]  诊断前的肥胖、诊断后不同化疗方法和疗程中的体重改变对乳腺癌的发生及预后均有重要的影响.身体成分被认为是较体重、身体质量指数(BMI)更加敏感的临床指标,脂肪、蛋白质、水和矿物质的不同组合形成了特殊的身体成分组成形态.基于不同身体成分组成形态及化疗过程中身体成分的改变实施有效的体重管理策略对乳腺癌患者的治疗和康复至关重要.据此,本研究立足于化疗期乳腺癌患者的体重管理,研究目的如下: 
学位
脑卒中是由于脑血管循环障碍(包括缺血和出血)造成的局灶性或全身性神经功能缺损综合征,并具有发病率高、复发率高、致残率高以及致死率高的特点。氯吡格雷,作为一种噻吩吡啶类的抗血小板药物,应用于脑血管疾病的二级预防已超过 20 年。尽管如此仍有相当多的一部分病人还是会出现缺血事件的复发。其中,基因多态性这一因素被认为是影响氯吡格雷反应差异最重要的因素。基于以上背景,本研究拟采用氯吡格雷治疗缺血性卒中的患
学位