一群自生固氮细菌的鉴定

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本文综述了生物固氮作用、自生固氮菌的主要类群、多相分类技术的研究进展,鉴定了13株自生固氮菌,其中包括对曾经被定名的AS1.1761、DSM1277和DSM2457进行重新鉴定。论文研究工作包括:测定上述细菌的16SrRNA基因序列、研究其生理生化性状、进行DNA同源性分析和系统发育学分析。结果表明AS1.1761、DSM1277和DSM2457属于Ancylobacter,但它们之间,以及与该属唯一的种水生微环菌(Ancylobacteraquaticus)之间均DNA同源性小于70%。所以,我们认为这三株菌是该属的三个新种,分别定名为Ancylobacterrudongense、Ancylobactervacuolatus和Ancylobacterpolymorphus。 同时,我们还研究了从云南土壤中分离到9株自生固氮菌AS1.3025、AS1.3033、AS1.3034、AS1.3035、AS1.3038、AS1.3039、AS1.3040、AS1.3041、AS1.3042,以及从宁夏污水中分离到一株自生固氮菌AS1.3820。系统发育学分析表明,AS1.3025属于小球菌属(Micrococcus),AS1.3033和AS1.3034属于土壤球菌属(Agrococcus),AS1.3035和AS1.3038属于节杆菌属(Anthrobacter),AS1.3039、AS1.3040、AS1.3041和AS1.3042属于红球菌属(Rhodococcus)。DNA-DNA杂交实验表明AS1.3025为Micrococcus的一个新种,AS1.3033和AS1.3034为Agrococcus的一个新种,AS1.3038为Anthrobacter的一个新种,AS1.3035与已知种模式菌株的DNA同源性为64.8%,它的分类地位有待于进一步确定。AS1.3039、AS1.3040、AS1.3041和AS1.3042属于Rhodococcusrhodorous。另外,系统发育学分析表明,AS1.3820属于生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae),与其亲缘关系最近的种为游离臂微菌(Ancalomicrobiumadetum),相似性仅为92.5%,它的分类地位有待进一步研究。
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