医药制造行业关系国计民生,由于行业的特殊性可以享受较多的税收优惠政策,因此涉税问题较为复杂。近年来,国家不断深入推动医药行业改革,医保控费、药品招投标等一系列政策频出,医药制造业发展迎来重大变革,医药制造企业面临较大的税务风险。在众多税种中企业所得税政策最为复杂,因此企业所得税的税务风险管理难度较大。在新形势下,如何以最小的成本有效防范和控制企业所得税税务风险成为医药制造企业亟待解决的问题。本文结合医药制造业的行业特征对其企业所得税风险管理要点进行梳理并以W制药公司作为案例分析对象对医药制造企业所得税风险管理进行研究。采用流程分析法对该企业生产经营的全流程进行梳理,同时结合财务分析法对企业近五年的企业所得税情况进行分析,识别其企业所得税税务风险。运用层次分析法构造企业所得税风险指标模型,对W制药公司的企业所得税风险进行评估,并对造成其企业所得税风险的内外部因素进行分析。在此基础上,站在企业内部控制与风险管理的角度,基于COSO内部控制框架五要素为W制药公司构建全面的、科学的税务风险管理体系提出合理化建议,希望能够提升其在企业所得税方面的税务风险防控能力,同时为其他医药制造企业加强企业所得税风险管理提供借鉴。医药制造企业应该通过建立适合自身的企业所得税风险管理体系,提升企业所得税风险防范和控制的能力,最大限度地减少因政策理解不到位或者税务处理不规范可能给企业造成的损失,从而提高企业的经济效益,增强市场竞争能力。